2008年08月28日，南汇大众新辟周康2路、周康3路、周康4路、周康5路。

2011年12月，浦东杨高（芦潮港分公司）、浦东南汇资产重组。原浦东杨高（芦潮港分公司）全部线路、浦东杨高（周浦分公司）部分线路并入浦东南汇，沪南线、周南线、南南线由浦东杨高、浦东南汇共同运营。原浦东南汇周康地区村村通公交同步划归浦东杨高（周浦分公司）运营。

2016年03月29日，浦东杨高周康5路（瑞浦路瑞安路棋瓦村）线路延伸，起讫站调整为瑞浦路瑞安路棋瓦路棋杆路。

2017年05月27日，浦东杨高周康5路（棋瓦路棋杆路瑞浦路瑞安路）线路延伸，起讫站调整为窑港大道周园路沈梅东路。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，浦东公交（浦东杨高、浦东上南、浦东金高、浦东南汇）除机场七线外所有线路暂停运营。

2022年05月30日，浦东杨高313路、343路、581路、639路、640路、777路、798路、988路、991路、1001路、1019路、1020路、1029路、1039路、1046路、1051路、1085路、1090路、1099路、1126路、1129路、1159路、1161路、浦东2路、浦东5路、浦东25路、浦东52路、浦东61路、浦东62路、浦东64路、浦东75路、浦东94路、浦东101路、北蔡1路、川沙3路、花木1路、陆家嘴金融城1路、陆家嘴金融城2路、陆家嘴金融城3路、陆家嘴金融城4路、周康4路、周康5路恢复运营。