1996年02月01日,公交总公司电车32路(雨花台中山码头)实施电改汽。
2006年07月25日,中北巴士11路、66路,公交总公司32路、43路、317路起讫站“龙江小区”更名为龙江新城市广场。
2013年06月01日,为优化人力资源和场站资源,江南公交第一巴士、第三巴士互换经营权,第一巴士75路划归第三巴士运营管理,第三巴士32路划归第一巴士运营管理。
2014年08月08日,江南公交36路、117路、141路、南栖线[同时番号调整为206路]、南上线[同时番号调整为207路]、南汤线[同时番号调整为208路]、817路[同时番号调整为Y17路]起讫站调整至南京站·北广场东;江南公交32路、64路、801路[同时番号调整为Y1路]、扬子公交汉江线区间线[同时番号调整为510路]、136路[同时番号调整为536路]起讫站调整至南京站·北广场西;江南公交117路(南堡公园西公交总公司)调整走向,起讫站调整为南堡公园西南京站·北广场西;游1路(迈皋桥广场中山陵停车场)缩线行驶并更名为201路,起讫站调整为南京站·南广场西中山陵停车场。
2016年07月01日,南京公交集团结束对中北巴士的托管管理,江南公交第一巴士公司旗下线路1路、3路、8路、11路、25路、28路、32路、40路、42路、45路、63路、64路、65路、66路、67路、68路、69路、71路、72路、73路、74路、76路、77路、79路、114路、122路、125路、130路、140路、143路、145路、146路、159路、176路、178路、184路、194路、195路、196路、197路、198路、199路、200路、201路、203路、206路、207路、208路、303路、308路、311路、315路、318路、319路、327路、328路、331路、332路、333路、334路、335路、336路、玉葛线、D5路、Y1路、Y19路、Y23路、B1路接驳线全面以公交集团标准运营管理,继续沿用第一巴士公司名称。
2019年11月01日,南京公交集团第一客运公司9路、11路、32路、42路、45路、65路、66路、105路划归第三客运公司运营管理。
2021年05月01日,南京公交集团第三客运公司9路、11路、32路、42路、45路、65路、66路、313路、Y11路划归第四客运公司运营管理。
2022年07月09日,为填补红山南路小市段公交线网空白,结合市公交集团在向市民征求意见期间市民所提出可行性的建议,南京公交32路(龙江新城市广场南京站·北广场西)调整走向,起讫站调整为龙江新城市广场南京站·南广场西;555路(天润城总站南京站·南广场西)调整走向,起讫站调整为天润城总站南京站·北广场西。
2024年05月13日,为进一步便利小市村、东井亭等地区市民的日常出行,我司通过优化公共交通网络,实现了更加顺畅地抵达城西地区及主要交通枢纽的换乘需求,让每一位市民都能享受到更加便捷、高效的出行体验,南京公交32路(龙江新城市广场南京站·南广场西)线路延伸,起讫站调整为龙江新城市广场东井亭【上行】/红山站龙江新城市广场【下行】;66路原“南京站·南广场西”上客站调整至龙蟠路·南京站西。