2003年06月26日，公交总公司新辟97路，起讫站为学院路公交总公司。

2004年08月18日，公交总公司97路（学院路公交总公司）线路延伸，起讫站调整为仙林灵山公交总公司。

2007年08月18日，为优化仙林地区公交线网结构，更好地解决大学城师生及市民出行问题，公交总公司50路（亚东新城区南京车站）调整走向，起讫站调整为亚东新城区公交总公司；97路（仙林灵山公交总公司）调整走向，起讫站调整为仙林灵山南京车站。

2010年11月01日，因地铁仙林中心站配建的公交枢纽即将投入使用，为充分利用新建场站，公交总公司50路、70路起讫站“亚东新城区”，公交总公司97路、中北巴士108路、146路起讫站“仙林灵山”延伸调整至仙林中心站。

2015年01月27日，为配合灵山北路总站投入使用，江南公交97路（仙林中心站南京站·南广场东）调整走向，起讫站调整为灵山北路总站南京站·南广场东；324路（仙林中心站仙林中心站）调整走向，起讫站调整为灵山北路总站十月科创园。