2008年02月05日，中北浦口新辟雨石线，起讫站为石桥雨花台南大门，经由南京长江三桥运行。

2014年11月01日，扬子公交高滨线更名为404路；桥二线更名为410路；燕郑线更名为412路；陈泉线更名为421路；九三线更名为422路；浦新线更名为512路；雨乌线更名为513路；雨石线更名为515路；151路更名为551路；151路区间更名为534路；167路更名为567路；168路更名为568路；江石线更名为684路。

2016年06月01日，扬子公交413路、414路、415路、416路、431路、515路、684路起讫站“石桥”更名为石桥客运站。

2019年09月30日，扬子公交515路改由南京长江隧道、南京夹江大桥运行。

2022年05月01日，为综合利用公交场站资源，降低线网重复系数，加强公交线路与轨道交通的衔接，方便群众出行，交通部门结合前期意见征集的结果，南京公交513路（乌江客运站雨花台南大门）缩线行驶，起讫站调整为雨山路地铁站雨花台南大门【同步实施无人售票，单一票价2元】；515路（石桥客运站雨花台南大门）缩线行驶并更名为401路，起讫站调整为石桥客运站双垅地铁站【同步实施无人售票，单一票价2元】。同时612路开行高峰巴士，起讫站为乌江客运站雨山路地铁站。