2000年02月12日，公交一公司[1-]新辟41路，起讫站为皇朝花园三塘小区。

2021年09月08日，公交三公司[3-]解散原五车队，70路由原五车队转入一车队，93路由三车队转入二车队，507H路由原五车队转入二车队，5路、40路、41路、41B路、1901路由原五车队转入三车队，34路、1104路由原五车队转入四车队，78路、305路、305路快线由原五车队转入五车队，原六车队更名为五车队（6路、22路、131路、135路、335路、371路、535路、535B路、535C路、1900M路、7262路、7292路）

2023年07月15日，为配合运营公司变更，原公交三公司[3-]三车队更名为六车队。变更线路：5路、28路、40路、41路、41B路、179路、1314路、1901路、1904路、7100路、8028路、8179路、市民中心3号线、市民中心3号线支线。

2023年07月30日，公交三公司[3-]41路调整走向，同步41B路撤销，