2010年03月13日，浦东上南796路暂停运营。787路（耀华博山东路枣庄路）同步调整走向，起讫站调整为长清路杨新路博山东路枣庄路。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，浦东公交（浦东杨高、浦东上南、浦东金高、浦东南汇）除机场七线外所有线路暂停运营。

2022年05月30日，浦东上南82路、84路、314路、338路、787路、795路、961路、970路、1008路、1025路、1048路、1115路、1160路、浦东37路、北蔡2路、三林1路、隧道三线恢复运营。

2024年04月01日，浦东上南六分公司454路、787路、981路、1007路、1008路、1013路、1115路、1160路、隧道三线、隧道夜宵线划入三分公司运营管理。