2002年07月07日，为配合沪闵路高架工程建设，缓解徐家汇地区交通，上奉线、沪兴线、沪泖线、沪浜线、上邵线、沪廊线、申金线、申南线调整至莘庄地铁南广场，分别更名为莘奉线、莘枫线、莘泖线、莘浜线、莘邵线、莘廊线、莘金线、莘南线；沪奉线、沪金线、申卫线、申师线、申廊线、沪钱线调整至外环路地铁站，分别更名为外奉线、外金线、外卫线、外师线、外廊线、外钱线；沪金线、申枫线、庄徐线、沪石线、沪漕线、沪卫线、沪山线调整至莲花路站，分别更名为莲金线、莲枫线、莲徐线、莲石线、莲漕线、莲卫线、莲山线。

2019年07月01日，莘南专线在地铁5号线结束运营前发车的班次不再绕行文化广场。

2019年12月28日，配合莘庄地铁站南广场公交枢纽站建成并投入使用，143路、725路、873路、闵行9路、闵行25路、闵行30路、闵行41路、机场九线、莘金专线、莘南专线、莘南高速线、莘虹快线终点站调整至莘庄地铁站南广场枢纽站内。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，奉贤巴士公交所有公交线路暂停运营。

2022年05月22日，奉贤巴士公交、奉贤客运部分跨区线路恢复运营。除虹桥枢纽5路B线外，所有线路目前均临时采取区间运营方式。452路起讫站为胡桥浦卫公路大叶公路，457路起讫站为公交南港路站金海公路大叶公路，458路起讫站为公交金钱公路站南行港路金海公路，643路起讫站为神州路公交四团站，虹桥枢纽5路起讫站为南桥汽车站公交西渡站，莘南专线起讫站为南桥汽车站金都雅苑，南松专线起讫站为南桥汽车站庄行，南航线起讫站为南桥汽车站梅园，上奉专线起讫站为南桥汽车站北新村，江五线起讫站为五四社区大叶公路沿钱公路，莘团线起讫站为奉城汽车站公交奉浦站，邵鹤线起讫站为邵厂新奉公路大叶公路，沪塘专线起讫站为塘外大叶公路沿钱公路，海航专线起讫站为海湾北行路贤浦路，海沈线起讫站为海湾金汇工业路，南申专线起讫站为南桥汽车站金汇工业路，江平专线起讫站为新杨公路芦五公路金汇工业路。2022年06月01日起上述线路恢复全程运行。