2016年04月30日，公交二公司将部分线路划转至公交五公司及公交三公司运营。其中公交五公司接收9路、92路、95路、96路、379路、636路、706路、826路、827路、831路、840路、849路、870路、872路、951路、953路、963路、968路；公交三公司接收311路。

2018年08月26日，公交五公司退出公交线路运营，所属线路划转至其它分公司。其中公交一公司接收公交五公司379路、870路，公交三公司接收公交五公司95路、96路、636路、684路、706路、826路、通勤826路、831路、838路、通勤838路，公交四公司接收公交五公司827路、840路，巴士实业接收公交五公司9路、通勤9路、92路、849路、872路、通勤872路、951路、953路、963路、968路。

2022年11月08日，因中山门社区内道路通行能力差，第一客运公司642路（龙洲道公交站中山门和睦道）正式缩短为龙洲道公交站昆仑桥西；巴士公司643路（华苑小区公交站中山门和睦道）正式缩短为华苑小区公交站昆仑桥西，92路（富民路公交站中心公园）调整部分中途走向。同时为方便中山门居民出行巴士公司新辟微循环线路643路区间（中山门虎丘路二宫中山门虎丘路），乘客可持乘车凭证免费换乘92路、642路、643路。

2023年12月09日，结合公交换乘优惠实施及前期线路调整，巴士实业92路（富民路公交站中心公园）缩短为富民路公交站大直沽三号路；901路（聚贤道公交站动物园公交站）缩短为聚贤道公交站新兴路。