2016年01月16日，江南公交新辟5路高峰巴士，起讫站为南湾营钟山学院。

2017年11月05日，江南公交5路高峰巴士（南湾营钟山学院）线路延伸，为进一步方便花岗保障房地区市民公交出行，起讫站调整为中花岗总站钟山学院。

2021年11月01日，因地铁2号线马群站临时封闭施工，南京公交5路高峰巴士、55路高峰巴士、163路、179路高峰巴士线路西端首末站临时延伸至钟灵街；314路临时延伸至金马路地铁站【至2021年12月11日恢复】。临时开行B7路接驳线（马群钟灵街）、B8路接驳线（马高路金马路地铁站）。

2023年09月20日，南京公交5路高峰巴士停止运营。