2011年08月28日，上午11时，在BRT3号线站台，一辆可以容纳一百余人的BRT大容量专用车驶入处于马路中央的站台，前来试乘的市民有序上车，随后车辆启动，驶离站台。此次试运营的有乌鲁木齐市城市交通投资有限责任公司运营的BRT1号线和BRT3号线。BRT站台的造型也是多种多样，例如农机厂站台，造型由一片片绿叶型天窗作为基本单元，汇聚成一颗苍天大树，象征着绿洲城市顽强的生命力，不仅样式特别，工艺也极为复杂，是所有站台中唯一的管桁架结构；劳动街站台，取义于乌鲁木齐市树大叶榆，象征古丝绸之路的盎然生机。在BRT1号线，有二十个中央岛式站台，上下行车辆利用同一个站台上下客，乘客不出站就可以实现免费换乘。

2012年07月06日，因三屯碑停车场施工，乌鲁木齐市城市交通投资有限责任公司、快速公交BRT3（三屯碑儿童公园）线路延伸，起讫站调整为烈士陵园儿童公园，因站台原因，不增设停靠站点

2012年09月28日，经实地考察，乌鲁木齐市城市交通投资有限责任公司、快速公交开通BRT3号线临时区间车,暂时抽调2辆12米车辆,于三屯碑陵园路段行驶，停靠沿途6个站点。

2012年12月08日，因站台建设完毕，乌鲁木齐市城市交通投资有限责任公司、快速公交BRT2号线增设北门（上行）站点，原站点更名为好家乡,BRT3号线增设乌管处（双向）县水泥厂（上行）站点，原BRT3号线临时区间车停止运营

2013年04月02日，乌鲁木齐市“BRT大容量快速公交系统建设项目”获得住房城乡建设部评选的2012年中国人居环境范例奖。

2013年04月03日，乌鲁木齐市城市交通投资有限责任公司、快速公交新辟BRT3号线区间车，起讫站为银川路人民广场。

2013年05月25日，本周末和六一儿童节，预计水上乐园的客流量将大幅增加，为确保市民正常出行，乌鲁木齐市城市交通投资有限责任公司、快速公交BRT3号线将在水上乐园北侧大门附近设置临时站点，抽调20辆BRT由人民广场发往水上乐园，营运时间为9时至20时。车辆前侧有区间车标识，乘车时需注意。

2013年08月21日，乌鲁木齐市城市交通投资有限责任公司、快速公交BRT3号线区间车（银川路-人民广场）已由原先的18米蓝色车辆换为12米黄色车辆，便于市民辨别选乘。同时，BRT3号线区间车的平均发车间隔时间也提至4.5分钟，增加发车密度已应对人民广场往银川路方向的大量客流。

2014年05月23日，乌鲁木齐公交系统安检全面升级，乘坐BRT快速公交的乘客，禁止携带液体和打火机乘车。9月10日，409辆BRT（包含环线快客）陆续安装“爆玻器”。在遇到紧急情况时，驾驶员只需摁下爆破按钮，1秒内公交车上的车窗玻璃就会瞬间爆裂，方便乘客逃生。

2014年12月02日，为配合地铁“南湖北路站”明挖施工需要，快速公交BRT3号线、BRT3号线区间车、BRT7号线移动公司站整体平移至北400米处新址，在投入运营前在原址搭建临时站台。

2015年，快速公交BRT3号线荣获自治区级“工人先锋号”称号。

2015年04月21日，快速公交BRT3号线“民族团结之家”线路启动试点，全线为乌鲁木齐市民提供无障碍语言沟通、特殊人群享受绿色通道等特色服务，每个站点均配备少数民族工作人员。为方便乘客，车队开展民族团结特色服务，并提出“热心、诚心、细心、恒心”四心优质服务，在各站台配备急救箱，通过车队、站点相结合的方式，对驾驶员及站台工作人员进行维吾尔语培训。其中BRT3066号车，南门、南湖小区两个站台先行试点开通。

2015年10月03日，为配合地铁“二道桥站”施工需要，快速公交BRT3号线调整走向，取消解放南路部分路段，改行龙泉街、新华南路、团结路驶回原线

2016年，快速公交BRT3号线荣获市级“工人先锋号”、全国“工人先锋号”称号

2016年03月01日，为配合地铁“北门站”、“南门站”施工需要，快速公交BRT3号线调整走向，下行取消解放北路路段，改行光明路、新华北路、人民路驶回原线。BRT2号线区间车下行取消BRT3号线北门站。

2017年09月25日，快速公交BRT3号线师范大学站台率先更换了新刷卡机，进行扫码支付试点，用户只需在手机下载“红山通”APP，用其生成的二维码对准刷卡机，即可“秒刷”乘车，相当于在手机“内置”了一个公交卡。

2017年10月05日，快速公交BRT3号线以及58路、907路公交车已经开启扫码乘车，可通过手机下载安装“红山通”APP软件，实现“扫码”乘车功能。

2017年12月05日，技术团队完成了BRT5号线站台的刷卡机更换工作，加上前期BRT1、2、3、4、6、7号线所属站台陆续完成更换，这意味着乌鲁木齐全部7条BRT线路均可实现手机支付。

2018年06月22日，为配合地铁“二道桥”、“南门”站施工需要，乌鲁木齐市城市交通投资有限责任公司、快速公交BRT3号线调整走向，双向取消龙泉街、解放南路、人民路路段，上行取消和平北路、中山路、健康路路段，改行新华南路、光明路驶回原线，下行改行新华南路驶回原线

2019年07月13日，为整合资源，减少与轨道交通重复距离，乌鲁木齐市城市交通投资有限责任公司、快速公交BRT3号线、BRT2号线区间车停止运营，BRT71号线线路延伸，起讫站调整为人民广场西山四道岔。