1994年，烟台市公共交通公司先后开通多条中巴线路：16路中巴（地方港客运站北上坊）、41路中巴（新石路西炮台南路）、42路中巴（幸福小区塔山游乐城）、43路中巴（新石路烟台山）、45路中巴（虹口路南塂）、46路中巴（师范学院宿舍区烟台山）、48路中巴（市公交修理厂虹口路）、49路中巴（新桥小区市建行）；1995年，新辟47路中巴（珠玑小区幸福八村）、52路中巴（青年南路林家疃）、53路中巴（解村莱山区政府）；1996年，新辟12路中巴（火车站奇山小区）、15路中巴（惠安小区长城宾馆）、44路中巴（福斯达纸业名人俱乐部）。

2002年10月16日，烟台市公共交通公司实行44路中巴退市项目，新辟44路大巴，线路实行无人售票，起讫站为蓁山花园福斯达公司。

2006年03月16日，烟台城市公交总公司44路（蓁山花园福斯达纸业公司）线路延伸，起讫站调整为蓁山花园开发区公交公司。

2007年01月16日，烟台城市公交总公司44路（蓁山花园开发区公交公司）线路延伸，起讫站调整为蓁山花园西蒙西。

2008年08月22日，烟台城市公交总公司44路（蓁山花园西蒙西）线路延伸，起讫站调整为蓁山花园金斯波格钢琴。

2012年08月19日，烟台公交44路（蓁山花园金斯波格钢琴）线路延伸，起讫站调整为富甲公交场站华安大酒店；53路（蓁山花园朱塂堡）线路延伸，起讫站调整为富甲公交场站朱塂堡。

2013年06月24日，烟台公交44路（富甲公交场站（机场路、大东路）华安大酒店）调整走向，起讫站调整为富甲公交场站（蓁山路、通世路）华安大酒店。

2017年05月20日，烟台公交西南河站点撤销，涉及21路、22路、42路、43路、44路、46路、80路、80路拥军专线、86路、86路拥军专线。

2021年07月10日，烟台公交28路（天马相城客运站旅游大世界）缩线行驶，起讫站调整为天马相城客运站火车站北广场；44路（富甲场站华安大酒店）缩线行驶，起讫站调整为富甲场站幸福中路场站。

2025年01月18日，烟台公交新购置的30辆宇通ZK6816BEVG23L型空调纯电动公交车辆，正式在44路、45路、201路、207路（含区间）上线运营。