2012年07月05日，浦东上南981路由三分公司移交六分公司经营管理。

2021年09月05日，浦东上南981路（海阳路长清路台儿庄路长岛路）缩线行驶，起讫站调整为海阳路长清路其昌栈渡口。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，浦东公交（浦东杨高、浦东上南、浦东金高、浦东南汇）除机场七线外所有线路暂停运营。

2022年05月27日，浦东上南83路、161路、572路、583路、604路、638路、784路、786路、789路、981路、1003路、1007路、1012路、1013路、1021路、1034路、1049路、1050路、1076路、1083路、1118路、1122路、1131路、浦东36路、浦东43路、浦东73路、浦东80路、浦东100路、花木2路恢复运营。

2023年03月26日，浦东上南981路（海阳路长清路其昌栈渡口）线路延伸，起讫站调整为前滩大道耀体路其昌栈渡口。

2024年04月01日，浦东上南六分公司454路、787路、981路、1007路、1008路、1013路、1115路、1160路、隧道三线、隧道夜宵线划入三分公司运营管理。