2019年11月19日，清溪公汽清溪8路划归东莞巴士运营管理，更名为799路（惠阳新圩约场交界清溪车站）。

2020年11月15日，东莞巴士799路（惠阳新圩约场交界处清溪汽车站）调整走向，起讫站调整为东莞耕山小寨清溪汽车站。

2024年01月10日，东莞巴士790路、798路、799路运营时间调整为07:00-10:00,16:00-19:00。

2024年10月26日，东莞巴士725路、751路、莞786路、798路、799路实行响应式停靠模式。

2025年01月01日，东莞巴士799路调整为鹿湖小区首末站耕山小寨鹿湖小区首末站环线，运营时间调整为06:30-09:30,16:00-19:00。