2016年10月13日，为配合长江大桥封闭维修改造，扬子公交503路（方州广场东古平岗）缩线行驶，起讫站调整为方州广场东柳洲东路总站西，同时番号调整为503区间。

2018年12月30日，扬子公交503路区间（方州广场东柳洲东路总站西）调整走向，起讫站调整为方州广场东中山北路·鼓楼【上行】/鼓楼公交总站方州广场东【下行】，番号恢复为503路，经由扬子江隧道运行。

2020年04月10日，根据六合区环保、交通等部门要求，南京公交503路（方州广场东中山北路·鼓楼【上行】/鼓楼公交总站方州广场东【下行】）调整走向，起讫站调整为六合北站中山北路·鼓楼【上行】/鼓楼公交总站六合北站【下行】；526路（六合北站迈皋桥广场）调整走向，起讫站调整为方州广场东迈皋桥广场。

2025年04月02日，为提高公交线路运营效率，南京公交503路售票方式由有人售票调整为无人售票，实行前门刷卡（码）上车、后门刷卡（码）下车，票价由2.5～5.5元下调为2～5元。