2014年08月20日,江南公交802路更名为Y2路;803路更名为Y3路;804路更名为Y4路;805路更名为Y5路;806路更名为Y6路;807路更名为Y7路;810路更名为Y10路;812路更名为Y12路;814路更名为Y14路;Y15路更名为Y15路;818路更名为Y18路;819路更名为Y19路;820路更名为Y20路;822路更名为Y22路;824路更名为Y24路。
2019年11月01日,因南京公交集团整体改制,原江南公交第五巴士公司负责运营的6路、10路、12路、18路、22路、24路、30路、31路、34路、53路、54路、78路、95路、117路、118路、134路、162路、302路、307路、337路、Y2路、Y9路、Y10路、Y15路整建制并入改制后的第一客运公司(原第一巴士公司)运营管理,第五巴士公司不再保留。
2021年03月10日,因地铁6号线施工需要,长途东站公交场站临时搬迁,南京公交2路、10路、28路、131路、165路、311路、Y10路起讫站临时由“长途东站”调整至墨香路总站。
2021年12月08日,因郑和中路与中山北路交叉口处污水管线施工,南京公交31路、34路、Y9路、Y10路、Y15路原“中山码头”下客站临时调整至中山码头北。【至2022年3月13日恢复】
2024年12月11日,为优化夜间公交线网布局,提升线路运行效率,南京公交Y1路(南京站·南广场西太平南路·夫子庙【上行】/建康路·夫子庙南京站·南广场西【下行】)线路延伸,起讫站调整为南堡公园太平南路·夫子庙【上行】/建康路·夫子庙南堡公园【下行】;Y10路(中山码头墨香路总站)调整走向,起讫站调整为南堡公园西墨香路总站。同时Y9路、Y19路停止运营。