2020年12月01日，城市小巴X16路（小享居委会 理工分校）缩线行驶，起讫站调整为石美枢纽 理工分校。
2023年10月23日，城市小巴X16路、X27路实行响应式停靠模式。
2025年01月25日，城市小巴X16路运营时间调整为06:30-09:30,16:30-19:30。
