2007年02月04日，公交总公司151路（长途客运北站鼓楼）线路延伸，起讫站调整为明发滨江新城鼓楼；614路（金宝浦口大市场化学工业园）线路延伸，起讫站调整为明发滨江新城化学工业园。

2008年05月28日，公交总公司151路（明发滨江新城鼓楼）线路延伸，起讫站调整为柳州路鼓楼。

2014年11月01日，扬子公交高滨线更名为404路；桥二线更名为410路；燕郑线更名为412路；陈泉线更名为421路；九三线更名为422路；浦新线更名为512路；雨乌线更名为513路；雨石线更名为515路；151路更名为551路；151路区间更名为534路；167路更名为567路；168路更名为568路；江石线更名为684路。

2016年10月28日，为配合长江大桥封闭维修改造，扬子公交502路、551路、555路、Y28路调整经由扬子江隧道运行，510路调整经由南京长江隧道、南京夹江大桥运行，558路、572路、Y29路暂停运行。

2018年12月30日，南京长江大桥恢复通车，扬子公交502路、551路、555路、D2路等线路调整经由南京长江大桥通行，558路恢复运营。

2019年05月06日，扬子公交551路、668路、Y40路起讫站“柳洲东路总站东”更名为柳洲东路地铁站东；690路起讫站“柳洲东路总站西”更名为柳洲东路地铁站西。

2022年10月13日，因柳洲东路公交场站地块进行施工，施工期间该场站临时搬迁至“江山路启新路”路口东侧地块，南京公交487路、636路原“柳洲东路总站【上客站】/柳洲东路地铁站西【下客站】”，690路起讫站“柳洲东路地铁站西”，551路、668路、Y39路、Y40路起讫站“柳洲东路地铁站东”，调整至柳洲东路地铁站北。

2024年10月11日，南京公交集团推出523路、551路为“敬老线”。