2010年04月01日，崇明巴士申崇二线区间更名为申崇四线。

2016年08月01日，申崇二线、申崇四线、申崇六线调整为由浦东金高、崇明巴士共同运营。

2020年05月11日，崇明巴士浦东金高申崇四线（上海科技馆地铁站长兴岛枢纽站）缩线行驶，起讫站调整为巨峰路地铁站长兴岛枢纽站。

2020年08月30日，配合长兴岛汽车站（凤舞路18号）投入使用，崇明巴士长兴1路、长兴2路、长兴3路、长兴4路终点站由马家港调整至长兴岛汽车站。长南线、陈凤线、横长线、申崇五线终点站由长兴岛枢纽站（凤凰镇汽车站）调整至长兴岛汽车站。崇明巴士浦东金高合营线路申崇四线、申崇四线区间终点站由长兴岛枢纽站（凤凰镇汽车站）调整至长兴岛汽车站。

2020年12月10日，为配合巨峰路地铁站公交枢纽施工搬迁，浦东金高、崇明巴士合营线路申崇二线、申崇四线临时调整走向，巨峰路地铁站终点站临时调整至五洲大道地铁站。申崇二线区间、申崇四线区间同步暂停运营。施工期间浦东金高临时新辟申崇免费短驳线，起讫站为巨峰路地铁站五洲大道地铁站。

2022年03月22日，根据疫情防控要求，巴士五公司申崇五线、崇明巴士申崇七线、崇明巴士浦东金高合营申崇四线暂停运营。

2022年06月01日，崇明巴士、浦东金高合营线路申崇四线恢复运营。

2024年01月01日，浦东金高四分公司拆分：611路、794路、1006路、1010路、1016路、1017路、1027路、1100路、曹路2路、浦东4路、浦东10路、申崇二线、申崇四线、申崇六线、申崇六线B线、申崇短驳线、高东班车划入二分公司，790路、曹路1路、曹路3路、浦东26路、浦东27路、浦东32路、浦东49路、浦东67路划入三分公司。