2003年07月08日，雅高巴士20路（鼓楼海底世界）线路延伸，起讫站调整为清凉门桥（好又多）海底世界。

2005年11月09日，雅高巴士20路（清凉门桥（好又多）海底世界）线路延伸，起讫站调整为宝船公园海底世界。

2006年08月01日，公交总公司9路、45路、47路、127路，雅高巴士20路，中北巴士65路、75路起讫站“宝船公园”更名为宁工新寓。

2006年09月28日，雅高巴士20路（宁工新寓海底世界）调整走向，起讫站调整为莫愁新寓海底世界。

2008年08月28日，雅高巴士20路，公交总公司150路、160路，新宁浦巴士307路原“莫愁新寓”上客站调整至莫愁湖公园西门。

2013年09月26日，南京公交雅高巴士有限公司委托南京公共交通（集团）有限公司运营管理。原定改称为南京江南公交客运有限公司第六巴士公司，未实际执行。

2014年04月19日，南京公共交通（集团）有限公司完成对南京公交雅高巴士有限公司的收购，由旗下江南公交负责雅高巴士线路的运营管理。雅高巴士一车队（2路、125路、315路、游5路）划入第一巴士管理运营，二车队（17路、23路、58路、93路、115路）划入第二巴士管理运营，三车队（6路、20路、91路、133路）划入第三巴士管理运营，四车队（173路、游1路、游2路、游3路、游4路）划入第四巴士管理运营。

2019年12月09日，南京公交新辟20路高峰区间，起讫站为莫愁湖公园西门鼓楼公园【上行】/鼓楼公园莫愁新寓【下行】。