2002年02月06日，昆明市公共汽车总公司新辟97路，起讫站为潘家湾（公汽公司）南苑小区；新辟98路，起讫站为菊花村苏家塘小区；新辟99路，起讫站为菊花村（灯具市场）小街；新辟100路，起讫站为明波家具超市近日公园。

2008年02月27日，为配合小西门"龟背立交”断交施工，昆明公交集团98路临时调整，去程按原线行驶至五一路，经五一路、铁局路、华山西路、青云街、文林街、东风西路回原线行驶，来回复行。临时新增站点：省公安厅（回）、如安街、五华广场、青云街、云南大学、府甬道。临时取消站点：艺术剧院、小西门、百汇商场。

2011年01月15日，为适应公交客运市场发展需要，增加公交服务多样性，进一步提升公交服务品质，满足市民出行需求，昆明公交集团新辟公交特色服务专线26路专线、54路专线、98路专线、115路专线、119路专线、127路专线、165路专线。公交特色服务专线起讫站与原有线路一致，优先选用大容量、高舒适度车型，专线车实行“优质高效”特色公交服务票制票价，票价按两元/人次执行，仅使用普通公交IC卡，使用学生卡、爱心卡、优惠卡的乘客乘坐特色服务专线车可选择使用卡内电子钱包或投币。

2014年01月11日，为配合地铁3号线省博物馆站（暂定名）结构建设，昆明公交集团98路（菊花村苏家塘）线路临时调整，去程按原线行驶至国防路口，经西昌路、人民西路，回原线行驶。回程线路不变。新增站点：靖国路口（去）、弥勒寺（去）、新闻路口（西昌路）（去）、篆塘（昆医附一院）（去）。线路调整后，运营时间、票制票价不变。

2017年10月09日，为配合昆明市“综合交通国际枢纽”项目建设，结合菊花村车场、巫家坝车场、东部修理公司临时车场周边路网通行条件及线网布局情况，昆明公交集团将对菊花村车场及巫家坝车场部分公交线路进行分批优化调整，共计线路17条，具体情况如下：（一）2017年10月09日起：5路（菊花村昆师路）线路延伸，起讫站调整为巫家坝车场茭菱路口（环城西路）；62路（菊花村梁源三区）线路延伸，起讫站调整为巫家坝车场梁源三区；62路空调车（菊花村马街（西部客运站））线路调整，起讫站调整为巫家坝车场梁源三区；254路（菊花村金星立交桥（金星地铁站B口））线路延伸，起讫站调整为巫家坝车场（雨龙路）金星立交桥（金星地铁站B口）；Z74路（菊花村关上（日新路））线路调整，起讫站调整为巫家坝车场（雨龙路）菊花村；109路（菊花村阳光花园小区）线路延伸，起讫站调整为巫家坝车场（雨龙路）阳光花园小区；184路（菊花村云南民族村）线路延伸，起讫站调整为巫家坝车场（雨龙路）云南民族村；238路（菊花村羊甫车场）由菊花村车场始发调整为羊甫车场始发，起讫站调整为羊甫车场菊花村。（二）2017年10月11日起：11路（巫家坝车场大板桥公交车场）线路调整，起讫站调整为菊花村大板桥公交车场；11路专线（巫家坝车场西冲村）线路调整，起讫站调整为菊花村西冲村；12路（巫家坝车场呈贡）线路调整，起讫站调整为菊花村呈贡；164路（巫家坝车场航天城）线路调整，起讫站调整为菊花村航天城；188路（巫家坝车场春漫大道（东信中心城））线路调整，起讫站调整为信息产业基地车场菊花村。（三）2017年10月20日起：51路（菊花村高峣）线路延伸，由东部修理公司临时车场始发，经归十西路、凉亭中路、金马路、彩云北路、东郊路回原线行驶，来回复行，起讫站调整为公交东部修理公司高峣；98路（菊花村苏家塘）线路延伸，由东部修理公司临时车场始发，经归十西路、凉亭中路、金马路、彩云北路、东郊路回原线行驶，来回复行，起讫站调整为公交东部修理公司苏家塘；72路（菊花村岗头村）线路延伸，由东部修理公司临时车场始发，经归十西路、凉亭中路、凉亭路、彩云北路、东郊路回原线行驶，来回复行，起讫站调整为公交东部修理公司岗头村；111路甲（菊花村菊花村）线路延伸，由东部修理公司临时车场始发，经归十西路、凉亭中路、金马路、东风东路、环城东路回原线行驶，来回复行，起讫站调整为公交东部修理公司公交东部修理公司。

2021年12月26日，为配合官渡区凉亭片区市政规划建设推进工作，东部修理公司临时车场停止使用，昆明公交集团51路（公交东部修理公司高峣）线路调整，起始站调整至巫家坝车场始发，经关景路、民航路回原线行驶，来回复行，起讫站调整为巫家坝车场高峣；98路（公交东部修理公司苏家塘）线路调整，起始站调整至巫家坝车场始发，经关景路、民航路回原线行驶，来回复行，起讫站调整为巫家坝车场苏家塘。72路（公交东部修理公司岗头村）线路调整，起讫站调整为北市区车场菊花村。111路甲（公交东部修理公司公交东部修理公司）线路调整，起始站调整至巫家坝车场始发，经关景路、民航路回原线行驶，来回复行，起讫站调整为巫家坝车场巫家坝车场。为满足凉亭片区出行需求，同步新辟Z16路临时接驳线，起讫站为公交东部修理公司菊华立交桥东口，临时接驳线将根据片区建设进度适时调整营运计划，保障片区居民出行需求。