2016年12月31日，按照北京公交集团与房山区政府共同签署的《房山区域公交合作协议》，落实好房山区域公交整合、区域线网优化、公交多样化服务、环保公交车更新、公交场站建设等六大合作项目，北京凯捷风公交客运有限责任公司环1路、环2路、房11路、房12路、房13路、房13支线、房14路、房14口儿村、房14东港、房14磁家务、房15路、房16路、房17路、房18路、房18支1、房18支2、房19路、房20路、房21路、房22路、房23路、房24路、房25路、房25支线、房26路、房27路、房28路、房29路、房30路、房31路、房31支线、房32路、房33路、房33支线、房34路、房35路、房36路、房36支线、房37路、房38路、房39路、房40路、房41路、房42路、房42夜班、房43路、房45路、房46路、房47路、房48路、房49路、房49支线、房50路、房51路、房52路、房53路由北京八方达客运有限责任公司大兴分公司继续运营。

2020年05月26日，第六客运分公司F49路支线更名为F78路。

2022年05月04日，按照房山区疫情防控工作要求，途经房山区阎村镇封控区周边的第六客运分公司646路、833路、903路、F13路采取区间运营措施；F1路、F2路、F5路、F27路、F43路、F46路、F47路、F48路、F49路、F50路、F57路、F61路、F69路、F70路、F78路、F79路采取暂停运营措施。

2025年03月26日，为进一步优化公交线路布局、提升公交服务质量、推动智慧交通建设，房山区交通局与第六客运分公司签署了新一轮《房山区域公交客运线路运营管理协议》，由第六客运分公司运营的F1路、F11路、F12路、F13路、F14路、F15路、F17路、F18路、F19路、F20路、F21路、F22路、F23路、F24路、F25路、F26路、F27路、F28路、F29路、F30路、F31路、F32路、F35路、F39路、F40路、F43路、F45路、F46路、F47路、F48路、F49路、F50路、F51路、F52路、F53路、F54路、F55路、F56路、F57路、F58路、F59路、F60路、F61路、F62路、F63路、F64路、F65路、F66路、F67路、F71路、F72路、F73路、F74路、F76路、F77路、F78路、F79路划归京西南客运有限公司运营。