2012年02月15日，浦东南汇南朝线更名为浦东9路。

2012年02月17日，浦东南汇浦东9路终点站延伸至朝丰农场（朝丰新村），南汇汽车站至朝阳农场区间车流水发班，全程车定班运营。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，浦东公交（浦东杨高、浦东上南、浦东金高、浦东南汇）除机场七线外所有线路暂停运营。

2022年05月27日，浦东南汇1038路、1069路、1108路、1127路、1138路、1162路、浦东7路、浦东9路、浦东23路、浦东24路、浦东30路、浦东31路、浦东34路、浦东51路、浦东55路、浦东69路、浦东70路、浦东79路、浦东92路、浦东96路、浦东104路、惠南3路、惠南4路、航头4路、祝桥2路、沪南线恢复运营。

2022年10月08日，配合朝丰村道路施工，浦东南汇浦东9路定班（南汇汽车站朝丰新村）暂停运营。