1990年06月26日，吉林市交通公司新辟39路（起讫站为化工医院松源公司）、40路（起讫站为化工医院百货大楼）。

2011年05月01日，吉林公交集团39路、47路、47路副线调整走向，始发站由东方家园更改为公交三公司。