2000年03月17日，西宁公交新辟15路，起讫站为新世纪花园泰宁花园；新辟16路，起讫站为三其西山川；新辟30路，起讫站为彭家寨康乐新村。

2001年01月20日，西宁公交16路（三其西山川）调整走向，起讫站调整为乐家湾观光园泰宁花园。

2014年12月21日，因西宁站升级改造工程完工，西宁公交1路（建国南路刘家沟桥）起讫站调整为火车站刘家沟桥；3路（建国南路南川工业园区）起讫站调整为火车站南川工业园区；5路（建国南路香格里拉）起讫站调整为火车站香格里拉；7路（海山建国南路）起讫站调整为海山火车站；9路（建国南路万佳家居博览中心）起讫站调整为火车站万佳家居博览中心；11路（青海大学青藏铁路公司）起讫站调整为青海大学火车站；16路（北杏园车辆段）起讫站调整为北杏园火车站；20路（南川公交小区小商品市场）起讫站调整为南川公交小区火车站；27路（海山建国南路）起讫站调整为海山火车站；28路（建国南路团结桥）起讫站调整为火车站团结桥；31路（建国南路海湖桥南）起讫站调整为火车站海湖桥南；40路（建国南路北杏园）起讫站调整为火车站北杏园；103路（城南新区（仁济医院）建国南路）起讫站调整为城南新区（仁济医院）火车站；104路（一机床车辆段）起讫站调整为一机床火车站；107路（一机床车辆段）起讫站调整为一机床火车站。

2019年11月24日，西宁公交四分公司16路（北杏园火车站）拆分为16路（刘家沟桥三角花园）、49路（海湖路南火车站）。因线路重复率过高64路（刘家沟桥小桥医院）、66路（刘家沟桥中心广场北）合并，保留线路号66路，线路走向调整，起讫站调整为青海师范大学（新校区）中心广场北。旅游观光专线（火车站火车站）调整走向并更名为游1，起讫站调整为火车站野生动物园。

2022年06月10日，西宁公交16路、49路、51路、501路、1002路、9001路停止运营。