1997年05月28日，公交一公司新辟36路，起讫站为杭州家私市场松木场。

2009年01月01日，公交一公司[1-]36路（杭州家私市场保俶路）调整走向，起讫站调整为科园路保俶路，63路（杭州家私市场古墩路南口）调整走向，起讫站调整为科园路古墩路南口

2013年06月05日，杭州公交一分公司36路起讫站保俶路更名为松木场河西。

2013年08月26日，杭州公交一分公司36路（科园路松木场河西）调整走向，起讫站调整为科园路公交一公司。

2014年04月01日，公交一公司18路、36路、63路、68路、84路、209路、218路、316路划归公交五公司[8-]运营管理。

2018年10月，公交五公司[8-]36路起讫点公交一公司更名为古翠路华星路口。

2019年03月13日，杭州公交五分公司36路（科园路古翠路华星路口）线路延伸，起讫站调整为皋亭新苑古翠路华星路口。

2019年07月20日，杭州公交五分公司36路（皋亭新苑古翠路华星路口）调整走向，起讫站调整为皋亭新苑万塘路塘苗路口。

2019年11月19日，杭州公交五分公司36路（皋亭新苑万塘路塘苗路口）线路延伸，起讫站调整为水田畈万塘路塘苗路口。

2020年04月18日，杭州公交五分公司36路起讫站万塘路塘苗路口调整为古荡湾。

2023年03月04日，公交五公司[8-]36路（水田畈古荡湾）缩线行驶，起讫站调整为水田畈卖鱼桥。