2020年10月13日，巴士集团开行第二代高品质机场快线系统及配套接驳线路：新辟A1路|机场福田线、NA1路|机场福田线夜班，起讫站为[正向]机场地面交通中心西平台华联大厦/[反向]华联大厦机场新航站楼；新辟A2路|机场龙华线，起讫站为[正向]机场地面交通中心西平台民治民塘路总站/[反向]民治民塘路总站机场新航站楼；新辟A4路|机场龙岗线，起讫站为[正向]机场地面交通中心西平台龙岗城市候机楼/[反向]龙岗城市候机楼机场新航站楼；新辟A5路|机场坪山线，起讫站为[正向]机场地面交通中心西平台燕子湖国际会展中心/[反向]燕子湖国际会展中心机场新航站楼；新辟M590路，起讫站为深圳机场场站机场码头；新辟M591路，起讫站为企岗山花园场站GTC企岗山花园场站；新辟M592路，起讫站为平安居场站GTC平安居场站。配合以上措施，西部公汽E32路更名为A7路；深圳机场运输330路|机场1线、330B路|机场2线、330C路|机场3线、330D路|机场4线同步停止运营。

2021年12月31日，巴士集团对高品质机场快线系统进行调整：新辟A3路|机场南山线，起讫站为[正向]机场地面交通中心西平台深圳湾口岸公交首末站/[反向]深圳湾口岸公交首末站机场新航站楼；新辟A6路|机场光明线，起讫站为[正向]机场地面交通中心西平台光明圳美总站/[反向]光明圳美总站机场新航站楼；NA1路|机场福田线夜班（[正向]机场地面交通中心西平台华联大厦/[反向]华联大厦机场新航站楼）调整走向，起讫站调整为[正向]机场地面交通中心西平台科学馆地铁公交接驳站/[反向]科学馆地铁公交接驳站机场新航站楼；A1路|机场福田线停止运营。

2023年06月11日，巴士集团与深圳机场集团合办“零点快线”市内接驳专线：新辟NA8路|机场布吉线夜班，起讫站为机场地面交通中心西平台荣超花园；新辟NA9路|机场燕罗线夜班，起讫站为机场地面交通中心西平台燕罗综治维稳中心；新辟H229路|定制巴士0879号，起讫站为科学馆地铁公交接驳站黄贝岭地铁站，与NA1路|机场福田线夜班直通运行；A6路|机场光明线（[正向]机场地面交通中心西平台星河天地公交场站/[反向]星河天地公交场站机场新航站楼）调整走向并更名为NA6路|机场光明线夜班，起讫站调整为机场地面交通中心西平台星河天地公交场站。

2023年11月21日，巴士集团对高品质机场快线系统进行调整：NA1路|机场福田线夜班（[正向]机场地面交通中心西平台科学馆地铁公交接驳站/[反向]科学馆地铁公交接驳站机场新航站楼）线路延伸，起讫站调整为[正向]机场地面交通中心西平台黄贝岭地铁站/[反向]科学馆地铁公交接驳站机场新航站楼，同时将线路辅助名称调整为机场福田罗湖线夜班；NA9路|机场燕罗线夜班调整为双向运营，同时将线路辅助名称调整为机场松岗燕罗线夜班；L6路|定制巴士0970号更名为NA11路|机场宝安西乡线夜班；H229路|定制巴士0879号停止运营。