2011年12月05日，浦东上南新辟1013路，起讫站为梅花路海桐路梅花路海桐路。

2015年12月28日，市运管处对48路、56路区间、108路区间、930路、1006路、1008路、1009路、1012路、1013路、1023路、1047路、1049路、1201路、1210路、1212路、1217路、1218路、宝山9路、周康10路、曹路3路等20条线路试点时刻表挂牌服务。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，浦东公交（浦东杨高、浦东上南、浦东金高、浦东南汇）除机场七线外所有线路暂停运营。

2022年05月27日，浦东上南83路、161路、572路、583路、604路、638路、784路、786路、789路、981路、1003路、1007路、1012路、1013路、1021路、1034路、1049路、1050路、1076路、1083路、1118路、1122路、1131路、浦东36路、浦东43路、浦东73路、浦东80路、浦东100路、花木2路恢复运营。

2024年04月01日，浦东上南六分公司454路、787路、981路、1007路、1008路、1013路、1115路、1160路、隧道三线、隧道夜宵线划入三分公司运营管理。