2005年，昆明公交集团开通118路（经济技术开发区南屏街东口）、119路（公交北市区车场正义路）、120路（湖畔之梦小区省政府（华山南路））、121路（潘家湾（公汽车场）羊仙坡北路）、127路（黄土坡前新路）、128路（公交北市区车场石关村）、129路（公交北市区车场理想小镇）主次干道城市公交线路7条，开通122路（东站（公汽车场）小口子村）、123路（经济技术开发区云大洋浦校区）、124路（大观楼艺术剧院）、125路（潘家湾正义路）、126路（公交北市区车场上坝村）、130路（六路车场积善村南）、131路（大观楼河尾村）、132路（昙华寺市政府）、133路（人民新村家乐福（世纪广场））、134路（站前路中苜蓿村）、135路（海埂旅游索道站海埂（体训）基地）、136路（公交北市区车场昆明铣床厂）、138路（省交通医院（西区）云南财贸学院（西区））、139路（省二监百汇商场）、140路（东站（公汽车场）东站（公汽车场））、141路（潘家湾（IC卡售卡中心）河尾小村）、142路（火车北站北辰小区）支线公交线路17条，极大提升了线网覆盖率。

2011年03月05日，为适应公交客运市场发展需要，增加公交服务多样性，进一步提升公交服务品质，满足市民出行需求，昆明公交集团新辟公交特色服务专线1路专线、52路专线、55路专线、62路专线、66路专线、69路专线、72路专线、74路专线、82路专线、83路专线、84路专线、90路专线、107路专线、118路专线、129路专线、140路专线、148路专线。公交特色服务专线起讫站与原有线路一致，优先选用大容量、高舒适度车型，专线车实行“优质高效”特色公交服务票制票价，票价按两元/人次执行，仅使用普通公交IC卡，使用学生卡、爱心卡、优惠卡的乘客乘坐特色服务专线车可选择使用卡内电子钱包或投币。

2012年06月09日，昆明公交集团129路（北市区车场理想小镇小区）线路延伸，起讫站调整为北市区车场逸雅路，票价同步调整为两元/人次。

2016年10月，昆明公交集团129路（北市区车场逸雅路）、Z67路（世纪城车场逸雅路）终到站更名，起讫站同步调整为北市区车场逸雅路口（华晨路）/世纪城车场逸雅路口（华晨路）。

2020年02月22日，按照昆明市应对新型冠状病毒感染肺炎疫情工作领导小组指挥部《关于恢复和调整昆明市道路、水路旅客运输及主城区部分城市公共交通运营的通告》有关要求及工作安排，昆明公交集团将部分恢复昆明市主城区公交线路。因疫情防控需要，线路将采取“跨站停靠”运行模式，具体恢复运营线路如下：1路、2路、3路、4路、5路、8路、9路、10路、23路、26路、32路、44路、54路、55路、61路、62路、66路、69路、72路、75路、79路、82路、83路、84路、89路、90路、91路、96路、101路、104路、105路、108路、111路甲、111路乙、113路、116路、118路、119路、127路、129路、146路、161路、168路、171路、191路、213路、236路、K9路、K12路、K15路、K19路、Z27路、Z28路。恢复线路将严格落实有关防控措施，切实维护公共卫生安全，乘车需佩戴口罩，对不佩戴口罩的乘客，公交驾驶员及监督员将劝导其佩戴口罩，乘客上下车时应主动完成“云南疫情通”扫码登记。

2022年10月24日，为进一步提升公交服务品质，昆明公交集团将分阶段开展公交线路品质化提升行动，自2022年10月24日起，将在人民路、龙泉路、金碧路、环城东路、环城西路、广福路等主干道试点推出首批“品质公交线路”：31路、54路、62路、111路甲、111路乙、129路、K52路。“品质公交线路”将在原线路既有服务的基础上，通过增加车辆投入、固定发车班次、提高服务质量、优化线路走向等措施来提高发车频次、缩短候车时间，有效提升营运效率。