2022年06月01日,为落实市委、市政府提升通州区域公交服务水平的要求,推动通州区域公交资源整合和经营体制机制改革,实现通州区域公交线网进一步优化,公共交通覆盖率进一步提高,进一步实现北京地面公交一体化,按照《通州区域公交承接总体协议》规定,北京市恒基客运公司有限公司通1路、通2路、通3路、通3路支线、通4路、通5路、通6路、通7路、通8路、通9路、通10路、通11路、通12路、通13路、通13路支线、通14路、通16路、通18路、通19路、通19路支线、通21路、通22路、通23路、通23路支线、通26路、通28路、通28路支线、通31路、通34路、通36路、通37路、通38路、通39路、通40路、通40路支线、通41路、通42路、通43路、通44路、通45路、通48路、通49路、通50路、通51路、通52路、通53路、通54路、通56路、通58路、通60路、通61路、通62路、通63路、通64路、通65路、通66路、通67路、通68路、通69路、通70路、通71路、通72路、通73路、通75路、通76路、通77路、通78路、郊86路、郊87路、郊90路划归北京公交集团城市副中心客运有限公司继续运营。其中郊86路更名为通86路,郊87路更名为通87路,郊90路更名为通90路。
2024年10月19日,为优化宋庄地区地面公交线网布局,提升安贞医院通州院区、友谊医院通州院区、孙各庄家园地面公交服务,同时削减客流低下线路,第五客运分公司新开通医专线12路(东小营公交场站友谊医院通州院区)、通医专线15路(地铁通州北关站安贞医院通州院区东门)、通医专线16路(安贞医院通州院区东门安贞医院通州院区东门),809路(佰富苑大北窑南)调整为佰富苑大北窑东,T119路(地铁潞城站疃里二区)停止运营,城市副中心客运有限公司T2路(郝各庄村通州北苑路口南)中途改行安贞医院通州院区、T61路(通州辛店公交场站运河明珠家园)中途改行潞苑四街、潞苑东路,首末站不变;同日起,第五客运分公司T120路(地铁潞城站六合新村)路号变更为专118路、T122路(地铁潞城站含章园五区)路号变更为专82路。