2023年10月13日，东部公交调整旗下部分e巴士短接驳线路的运营模式：在D17路|定制巴士3666号的基础上新辟高峰专线17号，前者调整为灵活开行；D8路|定制巴士3657号（石芽岭地铁站联创科技大厦石芽岭地铁站）调整走向并更名为B828路，起讫站调整为石芽岭地铁站联创科技园二期；D33路|定制巴士3682号更名为高峰专线58号。

2024年09月01日，东部公交调整旗下部分车队编制：二分公司（三联车队）（303路、381路、937路、高峰专线40号）、二分公司（吉华车队）（M138路、M224路、M273路、M324路、M363路、M565路、高峰专线47号）、二分公司（华龙车队）（369路、956路、M414路、M541路）、二分公司（南岭车队）（323路、377路、822路、B881路、B882路、B896路、B898路、B954路、M272路、M428路）、三分公司（长宜车队）（M261路、M265路、M267路、M290路、M370路、M412路、M498路）、三分公司（平安车队）（M270路、M311路、M385路、高峰专线183号）、三分公司（金荣车队）（979路、M154路、M172路、M269路、M283路、M573路）划转至一分公司；一分公司（丰源车队）（M395路、M415路、M452路、高快巴士50号）、一分公司（石岩湖车队）（326路、M233路、高快巴士49号、高快巴士51号）、一分公司（龙华车队）（M188路、M360路）、一分公司（宝安车队）（M234路、M413路）、一分公司（桃源居车队）（M194路、高快巴士32号、高快巴士47号）划转至二分公司；五分公司（汇源车队）（862路、M239路、高峰专线82号）、五分公司（富临车队）（E25路、M139路、M275路、M308路、M316路、M367路、高峰专线17号|D17路|定制巴士3666号）、五分公司（裕民车队）（811路、978路、M149路、M163路、M219路、M280路）划转至三分公司；M229路由三分公司（六和车队）划转至三分公司（吉祥车队）。