2012年01月15日，浦东南汇新辟申港3路，起讫站为宜浩家园飞渡路鸿音路。

2013年12月29日，浦东南汇申港3路（宜浩家园飞渡路鸿音路）线路延伸，起讫站调整为滴水湖地铁站飞渡路鸿音路。

2014年09月28日，配合滴水湖枢纽站投入使用，浦东南汇1009路、1043路、申港3路、洋山专线终点站滴水湖地铁站调整至枢纽站站内发车。

2016年12月17日，浦东南汇申港3路（滴水湖地铁站飞渡路鸿音路）调整走向，起讫站调整为临港大道地铁站鸿音路南芦公路。申港3路五七农场定班同步调整起讫站为临港大道地铁站五七农场。

2022年01月01日，浦东南汇三分公司所有线路划入临港公交运营管理。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，临港公交所有公交线路暂停运营。

2022年06月01日，除洋山专线外，临港公交所有线路恢复运营。

2022年08月20日，临港公交申港3路五七农场定班车（临港大道地铁站五七农场）停止运营。

2024年08月07日，临港公交1077路、1078路、临港4路、临港10路、临港11路、临港12路、申港3路、浦东29路、临港定制15线临港大道枢纽站首末站迁至临港大道南侧（近银飞路）枢纽站内。