2018年12月30日，第六客运分公司新辟F5路。

2022年05月04日，按照房山区疫情防控工作要求，途经房山区阎村镇封控区周边的第六客运分公司646路、833路、903路、F13路采取区间运营措施；F1路、F2路、F5路、F27路、F43路、F46路、F47路、F48路、F49路、F50路、F57路、F61路、F69路、F70路、F78路、F79路采取暂停运营措施。

2022年06月02日，按照疫情防控工作要求，前期受房山区疫情封控影响的第六客运分公司831路、833路、906路、956路、专93路、专94路、F1路、F5路、F12路、F13路、F14路、F16路、F17路、F18路、F28路、F30路、F31路、F32路、F33路、F38路、F41路、F42路、F45路、F51路、F55路、F56路、F68路、F71路、F72路、F74路、F76路、F79路、F80路、F82路、F83路、F92路恢复全线运营；616路、646路、835路、837路、839路、901路快车、903路、904路、912路、917路快车、F11路、F15路、F26路、F34路、F35路、F37路、F52路、F53路、F54路、F63路、F70路、F75路、F81路恢复区间运营。

2023年04月15日，因线路整体客运量较低，沿线途经路段均有其他线路承担地面公交基础服务，为提升有限公共资源的使用效率，第六客运分公司F5路（首发物流首发物流）停止运营。