2006年09月26日,北京公交集团实施第二批优化公交线网方案,新辟427路(城铁龙泽苑站龙跃苑一区东门)、428路(城铁龙泽苑站天通北苑)、429路(城铁龙泽苑站吉晟别墅)、460路(马连店马连店)、461路(马连店马连店)、462路(二拨子新村新都东站)、463路(北亚花园城铁龙泽苑站)、464路(回南家园和平东桥)、465路(南七家大羊坊)、466路(北苑家园中关村南)、467路(善各庄静安庄)、468路(朝新嘉园四惠站)、469路(颐和园西门五路)、470路(城铁望京西站城铁望京西站)、471路(城铁望京西站城铁望京西站)、472路(玉泉路口南金安桥北)、473路(玉泉路口南六里桥北里)。
2015年05月26日,第一客运分公司13路、21路、24路、62路、65路、119路、120路、125路、301路、569路、快速公交3线|BRT3、快速公交3线区间|BRT3区间、专22路划转至电车客运分公司;132路划转至第八客运分公司;659路划转至第七客运分公司;328路划转至第四客运分公司。第二客运分公司2路、5路、7路、12路、14路、17路、19路、25路、36路、39路、56路、59路、69路、70路、71路、525路、603路、685路、快速公交1线|BRT1、专26路、专56路划转至电车客运分公司;66路、511路、556路、夜12路划转至第三客运分公司;夜15路划转至第六客运分公司。第三客运分公司523路、623路、736路、741路、专96路划转至第二客运分公司;318路、327路、385路、396路、472路、473路、663路、特6路、特10路、特19路、专91路、专108路、专109路、专110路、融景城便民班车划转至第六客运分公司;469路、505路、508路、539路、579路、特4路、特5路划转至第四客运分公司。第四客运分公司15路、16路、26路、45路、46路、47路划转至电车客运分公司;专13路划转至第二客运分公司;395路划转至第三客运分公司。第五客运分公司9路、43路、75路、95路、635路、快速公交2线|BRT2、快速公交2线区间|BRT2区间划转至电车客运分公司;421路划转至第八客运分公司;639路划转至第七客运分公司。第六客运分公司10路、20路、夜17路划转至电车客运分公司;63路、83路、309路、310路、313路、321路、321路区间、323路、338路、351路、354路、451路、477路、480路、661路、692路、专27路划转至第三客运分公司。第七客运分公司特12路内环、特12路外环、夜20路划转至电车客运分公司;467路、660路、677路、专112路、专116路划转至第八客运分公司;54路、684路划转至第二客运分公司;549路、608路划转至第四客运分公司;8路、674路划转至第五客运分公司;689路划转至第一客运分公司。第八客运分公司44路内环、44路外环划转至电车客运分公司;378路、602路划转至第二客运分公司;645路划转至第六客运分公司;特16路划转至第七客运分公司;72路划转至第三客运分公司;630路、696路、698路、714路划转至第四客运分公司;466路划转至第一客运分公司。电车客运分公司359路、418路、夜10路划转至第七客运分公司;423路划转至第三客运分公司。同日起原有的两家分公司联营的夜班线路全部取消联营,由一家分公司独立运营,第二客运分公司与电车客运分公司联营的夜2路由电车客运分公司运营;第四客运分公司与第五客运分公司联营的夜3路由第四客运分公司运营;第三客运分公司与第六客运分公司联营的夜5路由第六客运分公司运营;第一客运分公司与第五客运分公司联营的夜6路由第五客运分公司运营;第三客运分公司与第六客运分公司联营的夜7路由第三客运分公司运营;第四客运分公司与第五客运分公司联营的夜13路由第五客运分公司运营;第一客运分公司与第三客运分公司联营的夜14路、夜18路由第一客运分公司运营;第四客运分公司与第六客运分公司联营的夜21路由电车客运分公司运营;第一客运分公司与第二客运分公司联营的夜24路由电车客运分公司运营;第一客运分公司与第五客运分公司联营的夜34路由第五客运分公司运营;第一客运分公司与第六客运分公司联营的夜36路由第三客运分公司运营。
2017年05月20日,因清苑路铁路桥限高,第一客运分公司484路(地铁北苑站北医三院)缩短为北苑家园北医三院;配合484路调整,466路(北苑家园中关村南)延长为地铁北苑站中关村南。
2021年06月05日,为提升大屯北路沿线地面公交基础服务,强化地面公交集约化服务特性,自首车起,调整第一客运分公司466路(地铁北苑站中关村南),调整后首末站不变,线路原通行科荟路、安立路、大屯路,调整后中途改行大屯北路。