2006年08月05日，公交总公司新辟141路（百水芊城南京车站）、142路（百水芊城环北市场）。

2009年08月01日，公交总公司141路、142路、163路起讫站由“百水芊城”延伸至南湾营。

2013年03月30日，江南公交5路（柳营莫愁新寓）调整走向，起讫站调整为南湾营长江路·估衣廊；9路（宁工新寓中山陵停车场）调整走向，起讫站调整为钟灵街宁工新寓；29路（杨庄五洲装饰城）调整走向，起讫站调整为杨庄莫愁新寓；34路（中山码头石门坎（五洲家居装饰广场））调整走向，起讫站调整为中山码头中山陵停车场并命名为“博爱线”；141路（南湾营南京车站）调整走向，起讫站调整为西花岗南京车站；163路（南湾营长江路）调整走向，起讫站调整为西花岗钟山学院；新辟D9路，起讫站为板桥新城（莲花湖公园）莫愁新寓。

2014年08月08日，江南公交36路、117路、141路、南栖线［同时番号调整为206路］、南上线［同时番号调整为207路］、南汤线［同时番号调整为208路］、817路［同时番号调整为Y17路］起讫站调整至南京站·北广场东；江南公交32路、64路、801路［同时番号调整为Y1路］、扬子公交汉江线区间线［同时番号调整为510路］、136路［同时番号调整为536路］起讫站调整至南京站·北广场西；江南公交117路（南堡公园西公交总公司）调整走向，起讫站调整为南堡公园西南京站·北广场西；游1路（迈皋桥广场中山陵停车场）缩线行驶并更名为201路，起讫站调整为南京站·南广场西中山陵停车场。