2019年06月26日，第六客运分公司新辟F62路、F63路。

2022年05月09日，按照房山区疫情防控工作要求，途经周口店镇的周边的第六客运分公司836路、F32路、F38路、F63路、F85路暂停运营；837路（东坟公交场站车厂村北）采取东坟公交场站燕化春光区间措施，F37路（周口店公交场站长阳碧桂园）采取燕山北庄长阳碧桂园区间措施。

2022年06月02日，按照疫情防控工作要求，前期受房山区疫情封控影响的第六客运分公司831路、833路、906路、956路、专93路、专94路、F1路、F5路、F12路、F13路、F14路、F16路、F17路、F18路、F28路、F30路、F31路、F32路、F33路、F38路、F41路、F42路、F45路、F51路、F55路、F56路、F68路、F71路、F72路、F74路、F76路、F79路、F80路、F82路、F83路、F92路恢复全线运营；616路、646路、835路、837路、839路、901路快车、903路、904路、912路、917路快车、F11路、F15路、F26路、F34路、F35路、F37路、F52路、F53路、F54路、F63路、F70路、F75路、F81路恢复区间运营。

2023年08月01日，因京昆路、涞宝路、军红路等山区路段受“7·31洪灾”影响冲毁，第六客运分公司F13路、F14路、F16路、F17路、F19路、F20路、F21路、F22路、F23路、F24路、F25路、F45路、F59路、F60路、F61路、F62路、F63路、F64路、F65路、F66路、F67路、F71路、F72路、F73路、F77路、通勤东湖港、通勤石花洞、通勤朱家坟；第八客运分公司948路暂停运营，恢复时间另行通知。

2025年03月26日，为进一步优化公交线路布局、提升公交服务质量、推动智慧交通建设，房山区交通局与第六客运分公司签署了新一轮《房山区域公交客运线路运营管理协议》，由第六客运分公司运营的F1路、F11路、F12路、F13路、F14路、F15路、F17路、F18路、F19路、F20路、F21路、F22路、F23路、F24路、F25路、F26路、F27路、F28路、F29路、F30路、F31路、F32路、F35路、F39路、F40路、F43路、F45路、F46路、F47路、F48路、F49路、F50路、F51路、F52路、F53路、F54路、F55路、F56路、F57路、F58路、F59路、F60路、F61路、F62路、F63路、F64路、F65路、F66路、F67路、F71路、F72路、F73路、F74路、F76路、F77路、F78路、F79路划归京西南客运有限公司运营。