2007年09月16日,北京公交集团实施第六批优化公交线网方案,调整一批穿城长途线路,削减中途站位改为大站快车,同时变更路号。735路(郁金香花园南门海淀桥东)调整并更名为641路;710路(善各庄新纪元石材市场)调整并更名为677路;801路快车(四方桥西颐和园北宫门)调整并更名为683路;705路(朝新嘉园建欣苑)调整并更名为686路;822路(北京华侨城南站宝隆公寓小区)调整并更名为687路,同时调整为北京华侨城宝隆公寓小区;804路(姜庄湖花乡驾校)调整并更名为689路,同时缩短为花乡驾校惠新东桥西;726路(前门颐和园)调整并更名为690路;719路(韩庄子北北京轮胎厂)调整并更名为691路;744路(北京站东世界公园公交总站)调整并更名为692路;748路(育新小区晓月苑小区)调整并更名为693路;702路(嘉铭园宝隆公寓小区)调整并更名为694路;727路(北京西站清河营村)调整并更名为695路;737路(香山孙河乡政府)调整并更名为696路;716路(菜户营桥东颐和山庄)调整并更名为697路;733路(香山城南嘉园北)调整并更名为698路;811路(富丰桥西回龙观小区)调整并更名为699路;840路内环(黄土岗村黄土岗村)调整并更名为特9路内环;840路外环(十八里店村十八里店村)调整并更名为特9路外环,同时调整为黄土岗村黄土岗村。
2010年01月26日,第一客运分公司24路、201路、379路、614路划转至第七客运分公司;8路、42路、60路划转至电车客运分公司;305路划转至新奥客运分公司。第二客运分公司20路、203路划转至第六客运分公司;300路内环划转至新奥客运分公司。第四客运分公司7路划转至第二客运分公司;10路、204路内环、204路外环、334路划转至第六客运分公司。第五客运分公司352路划转至第二客运分公司;359路划转至第七客运分公司;300路外环、378路、439路划转至新奥客运分公司。第六客运分公司631路、631路快车划转至第二客运分公司;356路、480路划转至第三客运分公司;58路、212路、311路、318路、327路、385路、396路、663路划转至双层客运分公司。第七客运分公司119路、125路、407路、426路划转至第一客运分公司;104路快车、110路、116路、515路、823路划转至电车客运分公司。电车客运分公司653路划转至第一客运分公司;410路、456路划转至第二客运分公司;411路划转至第五客运分公司。新奥客运分公司681路、699路、839路划转至第一客运分公司,477路、658路、694路、697路、717路划转至第三客运分公司;509路、518路划转至第四客运分公司;75路、635路、718路划转至第五客运分公司;64路、611路、612路划转至第六客运分公司;605路、682路、701路划转至第七客运分公司。专线客运分公司482路、498路、562路划转至第四客运分公司;457路、561路划转至第五客运分公司;802路划转至第六客运分公司;467路、660路、677路划转至第七客运分公司。双层客运分公司504路、679路划转至第二客运分公司;678路、692路划转至第三客运分公司;489路、746路划转至第四客运分公司;527路、728路划转至第六客运分公司;707路划转至第七客运分公司。
2010年10月26日,北京公交集团撤销原第三客运分公司、第七客运分公司,两分公司线路划转至其他分公司运营。第一客运分公司接收第三客运分公司658路、694路;第七客运分公司24路、120路、131路、201路、208路、379路、536路、659路。第二客运分公司接收第三客运分公司5路、49路、67路、340路、349路、390路、497路、603路、678路、三环临线。第四客运分公司接收第三客运分公司40路、45路、46路、47路、332路、507路、613路、697路、717路。第五客运分公司接收第七客运分公司122路、126路、211路、412路、419路、420路、421路、494路、503路、605路、628路、639路、640路、682路。第六客运分公司接收第三客运分公司63路、72路、205路、309路、321路、321路区间、323路、323路快车、477路、480路、604路、661路、692路。电车客运分公司接收第三客运分公司6路、22路、38路、82路、394路;第七客运分公司55路、113路、132路、210路、359路、401路、418路。双层客运分公司接收第三客运分公司77路、339路、339路区间、356路、391路、452路、458路、459路、550路、616路、646路、662路,同时更名为第三客运分公司。专线客运分公司接收第七客运分公司402路、403路、405路、413路、424路、431路、445路、446路、467路、516路、538路、595路、629路、656路、660路、677路,同时更名为第七客运分公司。新奥客运分公司接收第三客运分公司44路外环、44路内环;第七客运分公司130路、404路、406路、408路、409路、415路、416路、417路、422路、470路、471路、547路、630路、657路、701路、707路,同时更名为第八客运分公司。
2013年01月26日,第六客运分公司692路(北京站东世界公园公交总站)缩短为世界公园公交总站永定门内。
2015年05月26日,第一客运分公司13路、21路、24路、62路、65路、119路、120路、125路、301路、569路、快速公交3线|BRT3、快速公交3线区间|BRT3区间、专22路划转至电车客运分公司;132路划转至第八客运分公司;659路划转至第七客运分公司;328路划转至第四客运分公司。第二客运分公司2路、5路、7路、12路、14路、17路、19路、25路、36路、39路、56路、59路、69路、70路、71路、525路、603路、685路、快速公交1线|BRT1、专26路、专56路划转至电车客运分公司;66路、511路、556路、夜12路划转至第三客运分公司;夜15路划转至第六客运分公司。第三客运分公司523路、623路、736路、741路、专96路划转至第二客运分公司;318路、327路、385路、396路、472路、473路、663路、特6路、特10路、特19路、专91路、专108路、专109路、专110路、融景城便民班车划转至第六客运分公司;469路、505路、508路、539路、579路、特4路、特5路划转至第四客运分公司。第四客运分公司15路、16路、26路、45路、46路、47路划转至电车客运分公司;专13路划转至第二客运分公司;395路划转至第三客运分公司。第五客运分公司9路、43路、75路、95路、635路、快速公交2线|BRT2、快速公交2线区间|BRT2区间划转至电车客运分公司;421路划转至第八客运分公司;639路划转至第七客运分公司。第六客运分公司10路、20路、夜17路划转至电车客运分公司;63路、83路、309路、310路、313路、321路、321路区间、323路、338路、351路、354路、451路、477路、480路、661路、692路、专27路划转至第三客运分公司。第七客运分公司特12路内环、特12路外环、夜20路划转至电车客运分公司;467路、660路、677路、专112路、专116路划转至第八客运分公司;54路、684路划转至第二客运分公司;549路、608路划转至第四客运分公司;8路、674路划转至第五客运分公司;689路划转至第一客运分公司。第八客运分公司44路内环、44路外环划转至电车客运分公司;378路、602路划转至第二客运分公司;645路划转至第六客运分公司;特16路划转至第七客运分公司;72路划转至第三客运分公司;630路、696路、698路、714路划转至第四客运分公司;466路划转至第一客运分公司。电车客运分公司359路、418路、夜10路划转至第七客运分公司;423路划转至第三客运分公司。同日起原有的两家分公司联营的夜班线路全部取消联营,由一家分公司独立运营,第二客运分公司与电车客运分公司联营的夜2路由电车客运分公司运营;第四客运分公司与第五客运分公司联营的夜3路由第四客运分公司运营;第三客运分公司与第六客运分公司联营的夜5路由第六客运分公司运营;第一客运分公司与第五客运分公司联营的夜6路由第五客运分公司运营;第三客运分公司与第六客运分公司联营的夜7路由第三客运分公司运营;第四客运分公司与第五客运分公司联营的夜13路由第五客运分公司运营;第一客运分公司与第三客运分公司联营的夜14路、夜18路由第一客运分公司运营;第四客运分公司与第六客运分公司联营的夜21路由电车客运分公司运营;第一客运分公司与第二客运分公司联营的夜24路由电车客运分公司运营;第一客运分公司与第五客运分公司联营的夜34路由第五客运分公司运营;第一客运分公司与第六客运分公司联营的夜36路由第三客运分公司运营。
2019年06月15日,第三客运分公司692路(世界公园公交场站永定门内、先农坛世界公园公交场站)调整中途走向,增加科兴路、康辛路、芳菲路地面公交线网覆盖,完善天坛医院周边地面公交线网布局,方便沿线乘客换乘地铁10号线,调整后首末站不变,原世界公园公交场站更名为丰葆路东口。
2022年05月21日,按照丰台区疫情防控工作要求,途经丰台区的第一客运分公司300路快车内环、300路快车外环;第二客运分公司53路;第三客运分公司48路、49路、50路、51路、54路、66路、67路、69路、72路、77路、83路、90路、133路、134路、137路、139路、144路、309路、310路、313路、321路、323路、329路、339路、343路、349路、351路、353路、354路、356路、366路快车、368路内环、368路外环、369路、377路、381路、381通勤快车、391路、395路、423路、434路、454路、458路、459路、470路、474路、477路、480路、483路、483通勤快车、497路、501路、511路、524路、526路、529路、550路、555路、556路、565路、576路、602路、622路、627路、652路、665路、676路、676通勤快车、678路、679通勤快车、680路、692路、830路、843路、964路、978路、983路、专4路、专9路、专13路、专17路、专18路、专27路、专33路、专55路、专57路、专59路、专62路、专63路、专65路、专67路、专68路、专115路、专130路、专145路、专149路、专161路、专162路、专163路、专177路、专178路、专179路、专180路、专190路、专199路、专209路、夜7路、夜16路、夜23路;第四客运分公司52路、76路区间、327路、436路、481路、507路、574路、611路、专146路;第五客运分公司825路、997路;第六客运分公司456路、646路、845路、848路、903路、912路、946路、968路、969路;电车客运分公司17路、25路、39路、70路、71路、128路、专26路、专30路、专34路、专53路、专76路、专155路、专156路、专176路、夜15路采取暂停运营措施;第一客运分公司4路、141路、694路、夜18路;第三客运分公司84路、142路、324路、366路、485路、599路、631路、679路、685路、687路、夜12路、夜28路、夜36路;第四客运分公司40路、57路、68路、76路、568路、598路、603路、612路、夜4路;第五客运分公司820路、821路、849路;第六客运分公司827路、829路、840路、954路、957路;第八客运分公司890路、941路、941路快车、961路、977路;电车客运分公司2路、5路、6路、7路、12路、14路、19路、38路、43路、45路、46路、59路、88路、120路、专154路、夜2路、夜11路采取区间运营措施。
2022年06月09日,按照疫情防控工作要求,前期受丰台区疫情管控影响的第一客运分公司4路、694路、夜18路;第二客运分公司53路、第三客运分公司、48路、49路、50路、51路、54路、62路、66路、67路、69路、72路、77路、83路、90路、91路、93路、96路、97路、133路、134路、142路、144路、309路、310路、313路、321路、323路、324路、329路、338路、339路、343路、349路、351路、353路、354路、356路、366路快车、368路内环、368路外环、369路、377路、381路、381通勤快车、390路、391路、395路、400路快车内环、400路快车外环、423路、434路、452路、454路、458路、459路、470路、474路、477路、480路、483路、483通勤快车、485路、497路、501路、511路、529路、550路、556路、599路、602路、622路、627路、631路、652路、665路、676路、676通勤快车、678路、679路、679通勤快车、685路、687路、692路、830路、843路、964路、978路、983路、专3路、专4路、专9路、专13路、专18路、专27路、专33路、专55路、专57路、专59路、专63路、专65路、专67路、专68路、专115路、专130路、专145路、专149路、专161路、专162路、专163路、专177路、专178路、专179路、专180路、专190路、专199路、专209路、夜7路、夜12路、夜16路、夜23路、夜36路;第四客运分公司40路、52路、57路、64路、68路、76路、335路、436路、473路、481路、507路、531路、568路、603路、611路、612路、644路、专127路、夜4路;第五客运分公司820路、825路、990路、997路;第六客运分公司456路、616路、646路、827路、829路、832路、835路、836路、839路、840路、845路、895路、896路、901路、901路快车、903路、912路、917路、934路、946路、951路、952路、954路、957路、967路、968路、969路、971路、993路;第七客运分公司973路;第八客运分公司890路、941路、941路快车、948路、958路、959路、961路、977路、982路;电车客运分公司2路、5路、6路、7路、12路、14路、17路、19路、25路、38路、39路、43路、45路、46路、59路、70路、71路、74路、88路、120路、128路、专26路、专30路、专34路、专53路、专76路、专138路、专154路、专155路、专156路、专176路、夜2路、夜11路、夜15路恢复全线运营;第一客运分公司141路;第三客运分公司84路、139路、366路、524路、526路、555路、576路、夜28路、专17路、专62路、专189路;第四客运分公司327路、554路、574路、624路、634路、专146路;第五客运分公司821路、828路、943路、986路;第六客运分公司838路、917路快车恢复区间运营。
2024年12月21日,为配合丰葆路东口场站腾退,线路调整引入郭公庄公交场站,第三客运分公司692路(丰葆路东口永定门内/先农坛丰葆路东口)调整为郭公庄西永定门内/先农坛郭公庄西。