1950年05月10日，公共汽车公司新辟京苑路（东华门南苑）。

1951年04月20日，公共汽车公司5路（前门鼓楼）延长为人民市场（先农坛）鼓楼，7路（前门西直门）延长为崇文门西直门；京颐路（东华门颐和园）调整为前门颐和园，京石路（东华门石景山）调整为前门石景山，京长路（东华门长辛店）调整为前门长辛店，京苑路（东华门南苑）调整为前门南苑，京通路（东华门通县）调整为前门通县。

1956年12月，公共汽车公司西颐路（西四丁字街颐和园）更名为31路，京颐路（西直门颐和园）更名为32路，颐香路（颐和园香山）更名为33路，西永路（西直门永定路）更名为34路，京门路（阜成门门头沟）更名为36路，京石路（前门石景山）更名为37路，京永路（前门玉泉路）更名为38路，京长路（前门长辛店）更名为39路，京丰路（前门丰台）更名为40路，京苑路（前门南苑）缩短为天桥南苑同时更名为41路，京通路（前门万寿宫）缩短为猪市大街万寿宫同时更名为42路，东酒路（东直门酒仙桥）更名为43路，德清路（德胜门回龙观）更名为44路。

1957年07月16日，公共汽车公司41路（天桥南苑）延长为天桥东高地。

1958年06月05日，公共汽车公司41路（天桥东高地）延长为前门东高地。

1959年09月01日，公共汽车公司41路（前门东高地）缩短为永定门东高地。

1971年08月01日，公共汽车公司41路（永定门东高地）延长为永定门万源路。

1972年11月，公共汽车公司在整理1972年客流调查资料后，提出开调线路的方案时，发现市区线路编号以30路为上限已不够使用，于是把由公共汽车所辖的郊区线路编号加上300。31路（平安里中关村）更名为331路；32路（动物园颐和园）更名为332路；33路（颐和园香山）更名为333路；34路（动物园永定路）更名为334路；35路（展览路丰台火车站）更名为335路；36路（展览路门头沟）更名为336路；37路（宣武门石景山）更名为337路；38路（宣武门永乐小区）更名为338路；39路（广安门云岗）更名为339路；40路（广安门丰台）更名为340路；41路（永定门万源路）更名为341路；42路（郎家园万寿宫/造纸厂）取消高峰时间联运，改为342路（郎家园通县）和317路（通县造纸厂）；43路（虎坊路三营门）更名为343路；44路（德胜门回龙观）更名为344路；45路（德胜门昌平）更名为345路；46路（颐和园温泉/西山农场）更名为346路；47路（动物园八大处）更名为347路；48路（方巾巷炼焦厂）更名为348路；49路（三营门南大红门）更名为349路；50路（朝阳门东坝）更名为350路；51路（右安门丰台）更名为351路；52路（光明楼小红门）更名为352路；53路（三营门丰台）更名为353路；54路（丰台火车站石景山）更名为354路；55路（中关村清河）更名为355路；56路（云岗大灰厂）更名为356路；57路（昌平高崖口）更名为357路；58路（安定门立水桥）缩短为地坛立水桥，同时更名为358路；59路（东直门首都机场）更名为359路；60路（动物园香山）更名为360路；61路（三营门旧宫）更名为361路；62路（颐和园东北旺公社）更名为362路；63路（八王坟红庄）更名为363路；64路（八王坟金盏路）更名为364路；65路（中关村体育学院）更名为365路；66路（永定门黄村）更名为366路。

1985年07月01日，公交总公司341路（永定门万源路）缩短为木樨园万源路。

1998年09月25日，第二客运分公司341路（木樨园万源路）延长为木樨园德茂庄，343路（虎坊路三营门）延长为虎坊路万源路，349路（三营门垡上）缩短为德茂庄垡上，353路（三营门马场）延长为万源路马场。

2001年11月08日，第二客运分公司341路（木樨园德茂庄）延长为木樨园青云店镇，同步撤销349路（德茂庄垡上）。

2005年12月30日，随着南中轴路快速公交系统施工全面完成，畅达通客运快速公交1线|BRT1由2004年底的一期试运营阶段（前门木樨园）转为全线贯通正式运营阶段（前门德茂庄）。配合快速公交1线全线开通，合理配置南中轴路公交资源，同时按照统一规范线路号和站名的计划，第二客运分公司341路（木樨园青云店镇）缩短为旧宫青云店镇；替代341路撤出路段，366路（木樨园黄村火车站）调整中途走向，改行大红门路，首末站不变；377路（永定门旧宫）调整为北京南站西红门西站。北京巴士729路（东坝建材城成和园小区）缩短为成和园小区前门；736路（德茂庄玉泉路）调整为灵秀山庄东站玉泉路口南；742路（742路[上林苑]）（前门上林苑小区）调整为上林苑小区四惠桥，742路[北普陀]（前门北普陀）缩短为北普陀影视城大红门桥并更名为736路区间；859路（坤江市场灵秀山庄）调整为马各庄坤江市场城南嘉园北。

2017年07月17日，第三客运分公司341路（旧宫青云店公交场站）缩短为德茂桥东青云店公交场站。

2022年12月26日，因青云店镇沿线周边地区已大幅拆迁，客流需求降低，第三客运分公司341路（德茂桥东青云店公交场站）停止运营。