2008年，曲靖市公共汽车总公司结合城市发展进程，进一步挖掘潜力，开辟公交线路。03月26日，将5路终到站由西苑小区延伸至师范学院。04月26日，将61路支线公交终到站延伸至一职中。11月26日，开通23路，起讫站为瑞和新城水寨（圣庭花屿），该线运营里程10.5公里。年内，曲靖市公共汽车总公司通过自筹资金，新购54台运营车辆，对6路、12路、33路车辆进行整体更新，通过开辟线路和更新车辆，公交营运效率和效益明显提高。

2017年02月28日，为进一步提高公交履盖率，曲靖市公共汽车总公司依托水寨公交枢纽站对5路（得胜家具城曲靖市医学高等专科学校）进行线路延伸，起讫站调整为水寨公交枢纽曲靖医专。新增站点：曲陆苑、曲靖广电、区检察院、市中级人民法院、锦湘南郡、水寨公交枢纽。取消站点：得胜家具城（起始站）、恩红煤矿基地（去）、金柯渡（去）、大观园（去）、曲陆苑（回）。线路调整后，运营时间、票制票价不变

2018年12月20日，根据曲靖市住房和城乡建设局《关于曲靖中心城区公交票价调整的批复》（曲建复[2018]63号），曲靖市公共汽车总公司决定对曲靖中心城区所属公交线路票价进行调整。现公告如下： 一、采用一票制乘车， 二、调价标准： 1、单边营运里程5公里内（含5公里）的公交线路（社区巴士），维持原票价1元/人次。包含线路：S1路。 2、单边营运里程5—20公里（含20公里）的公交线路，票价由1元/人次（含1.5元/人次），调整为2元/人次。包含线路：1路、2路、3路、4路、5路、6路、7路、9路、10路、11路、16路、17路、19路、21路、22路、23路、31路、32路、33路、36路、37路、61路、68路。 3、单边营运里程20—30公里（含30公里）的公交线路，票价调整为3元/人次。包含线路：12路、62路。 4、公交快线票价调整为3元/人次。包含线路：K1路。 三、优惠措施： 1、IC卡刷卡乘车优惠不变，按照学生卡6折、成人卡8折执行。 2、现役军人、老年人、残疾人，票价调整后按照有关政策实行免费乘车。

2020年02月05日，为有效切断新型冠状病毒传播途径，确保人民群众生命安全，根据《中华人民共和国传染病防治法》等法律规定及曲靖市和麒麟区已发布的暂停道路客运班线及其它客运的公告要求，结合省委、省政府公共卫生事件一级响应工作部署及市、区疫情防控工作要求。经研究，曲靖市公共汽车总公司决定暂停和调整曲靖市主城区公交线路，以便防控工作有效开展，自零时起暂停运营：2路、3路、6路、7路、9路、10路、11路、12路、16路、17路、19路、21路、31路、33路、36路、37路、61路、62路、68路、S1路、S3路。保障运营线路：（共7条）1路、4路、5路、22路、23路、32路、K1路，运营时间7:30－18:30（上午7:30－8:30，下午17:30—18:30时段每20分钟一班，其余时段每小时一班），恢复时间视疫情处置情况另行通知。

2020年03月01日，根据曲靖市交通运输系统新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控工作领导小组办公室关于企业复工复产和疫情防控的工作部署，结合我市疫情防控现状和客流实际，为更好地满足市民日常公交出行需求，曲靖市公共汽车总公司决定自零时起，全面恢复市区28条（1路、2路、3路、4路、5路、6路、7路、9路、10路、11路、12路、16路、17路、19路、21路、22路、23路、31路、32路、33路、36路、37路、61路、62路、68路、K1路、S1路、S3路）公交线路运营。疫情防控期间，运营时间统一按早7:00开班，晚19:00收班执行。

2023年05月18日，为进一步优化线网布局，结合市民意见建议，经实地勘察，曲靖公交将在麒麟南路由北向南方向新增珠江源广场站，新增站点停靠线路：1路、5路、15路、23路、28路、66路、K1路。

2023年08月19日，曲靖公交5路（水寨公交枢纽曲靖医专（南））终到站更名，起讫站同步更名为水寨公交枢纽市二中。