2023年09月21日，东部公交调整旗下部分线路运营模式：323路（罗岗总站裕安西路公交总站）调整走向，起讫站调整为[正向]罗岗总站裕安西路公交总站/[反向]裕安西路公交总站可园学校；328路（君子布公交首末站南山汽车总站）调整走向，起讫站调整为[正向]君子布公交首末站南山汽车总站/[反向]南山汽车总站新田路口；377路（南岭总站福田交通枢纽公交场站）调整走向，起讫站调整为[正向]南岭总站福田交通枢纽公交场站/[反向]福田交通枢纽公交场站可园学校；979路（辅城坳公园总站六约地铁公交接驳站）调整走向，起讫站调整为[正向]启英学校牛始埔居民小组/[反向]六约地铁公交接驳站启英学校；980路（布吉下李朗总站深圳东站枢纽西广场公交站）调整走向，起讫站调整为下李朗市场深圳东站枢纽西广场公交站；E10路（君子布公交首末站购物公园地铁公交接驳站）调整走向，起讫站调整为[正向]君子布公交首末站购物公园地铁公交接驳站/[反向]购物公园地铁公交接驳站融悦山居；E27路（坂田五和总站远洋新干线公交首末站）调整走向，起讫站调整为[正向]坂田五和总站远洋新干线公交首末站/[反向]远洋新干线公交首末站五和风门路口；M138路（秀峰公交总站椰风路口）调整走向，起讫站调整为[正向]秀峰公交总站椰风路口/[反向]椰风路口丽湖花园；M154路（辅城坳公园总站丹竹头地铁站辅城坳公园总站）调整走向，起讫站调整为启英学校丹竹头地铁站启英学校；M172路（辅城坳公园总站文锦渡公交总站）调整走向，起讫站调整为启英学校文锦渡公交总站；M271路（吉厦总站坂田国际中心总站）调整走向，起讫站调整为[正向]吉厦总站坂田国际中心总站/[反向]坂田国际中心总站吉厦路口；M273路（秀峰公交总站深圳东站枢纽西广场公交站）调整走向，起讫站调整为[正向]秀峰公交总站深圳东站枢纽西广场公交站/[反向]深圳东站枢纽西广场公交站甘坑地铁站；M319路（龙西总站龙岗区残联）调整走向，起讫站调整为[正向]龙西总站龙岗区残联/[反向]龙岗区残联白沙水一巷；M463路（布吉慢城总站乐尚林居公交首末站）调整走向，起讫站调整为[正向]布吉慢城总站乐尚林居公交首末站/[反向]乐尚林居公交首末站布龙立交；M491路（海吉星公交总站雅宝小学）调整走向，起讫站调整为[正向]海吉星公交总站雅宝小学/[反向]雅宝小学海吉星路口；M556路（桑泰龙樾府公交首末站龙岗麓园总站）调整走向，起讫站调整为[正向]桑泰龙樾府公交首末站龙岗麓园总站/[反向]龙岗麓园总站仙田路南。
2024年05月01日，东部公交平湖辅城坳总站停止使用：977路（融悦山居田贝总站）调整走向，起讫站调整为[正向]君子布公交首末站田贝总站/[反向]田贝总站融悦山居，并由三分公司（金荣车队）划转至二分公司（君子布车队）；M261路（平湖辅城坳总站特发天鹅湖公交首末站）线路延伸，起讫站调整为中科谷总站特发天鹅湖公交首末站，并划转至三分公司（长宜车队）；M283路（融悦山居草埔地铁站）缩线行驶，起讫站调整为[正向]港龙草埔地铁站/[反向]草埔地铁站启英学校；高峰专线33号（[正向]融悦山居田贝总站/[反向]田贝总站辅城坳天桥）线路延伸，起讫站调整为观澜大水田总站田贝总站，并由三分公司（金荣车队）划转至二分公司（观澜车队）；高峰专线183号划转至三分公司（平安车队）；P106路|定制巴士2106号、P218路|定制巴士2218号、P292路|定制巴士2292号、P1003路|定制巴士3003号划转至二分公司（观澜车队）；三分公司（嘉湖车队）（979路、M154路、M172路、M269路、M573路）整体并入三分公司（金荣车队）。
2024年09月01日，东部公交调整旗下部分车队编制：二分公司（三联车队）（303路、381路、937路、高峰专线40号）、二分公司（吉华车队）（M138路、M224路、M273路、M324路、M363路、M565路、高峰专线47号）、二分公司（华龙车队）（369路、956路、M414路、M541路）、二分公司（南岭车队）（323路、377路、822路、B881路、B882路、B896路、B898路、B954路、M272路、M428路）、三分公司（长宜车队）（M261路、M265路、M267路、M290路、M370路、M412路、M498路）、三分公司（平安车队）（M270路、M311路、M385路、高峰专线183号）、三分公司（金荣车队）（979路、M154路、M172路、M269路、M283路、M573路）划转至一分公司；一分公司（丰源车队）（M395路、M415路、M452路、高快巴士50号）、一分公司（石岩湖车队）（326路、M233路、高快巴士49号、高快巴士51号）、一分公司（龙华车队）（M188路、M360路）、一分公司（宝安车队）（M234路、M413路）、一分公司（桃源居车队）（M194路、高快巴士32号、高快巴士47号）划转至二分公司；五分公司（汇源车队）（862路、M239路、高峰专线82号）、五分公司（富临车队）（E25路、M139路、M275路、M308路、M316路、M367路、高峰专线17号|D17路|定制巴士3666号）、五分公司（裕民车队）（811路、978路、M149路、M163路、M219路、M280路）划转至三分公司；M229路由三分公司（六和车队）划转至三分公司（吉祥车队）。