2016年06月01日，扬子公交403路、404路、430路、601路起讫站“高旺”更名为高旺公交总站北。

2020年12月01日，南京公交403路（高旺公交总站北兰花塘地铁站）恢复运行并线路延伸，起讫站调整为五里桥立交北兰花塘地铁站；404路（高旺公交总站北绕河路西）恢复运行并调整走向，起讫站调整为五里桥立交北兰花塘地铁站。

2021年11月06日，因浦口区浦乌路快速化改造，施工期间浦乌北路（建设路至园广路路段）禁止机动车通行，南京公交403路、404路、613路起讫站由“五里桥立交北”临时调整至建设路总站。

2023年07月23日，为配合浦口区城西枢纽公交场站投入使用，南京公交403路、404路、601路、613路、D59路上客站“建设路总站”更名为雨山路地铁站南，下客站由“建设路总站”调整至雨山路地铁站东。

2024年04月20日，为优化公交线网资源配置,促进路面公交与轨道交通两网融合，解决浦口经济开发区企事业单位员工上下班高峰期间交通不便问题，结合线路优化调整意见征集公示期间市民提出的建议，南京公交403路（雨山路地铁站南兰花塘地铁站【上行】/兰花塘地铁站雨山路地铁站东【下行】）调整走向，起讫站调整为江浦客运站南（2站台）丝兰湖总站【上行】/丝兰湖总站江浦客运站东【下行】。

2024年09月24日，为优化公交线网资源配置，综合利用浦口区城西换乘枢纽功能，同时填补江北新区兴隆路、横江大道、镇南河路、七里河桥、鹰击路、霄汉街等部分路段道路空白，加强与地铁站、图书馆之间的衔接。南京公交400路（江浦客运站西狮子岭【上行】/狮子岭江浦客运站南【下行】）缩线行驶，起讫站调整为雨山路地铁站南狮子岭【上行】/狮子岭雨山路地铁站东【下行】；402路（江浦客运站西西江佳园【上行】/西江佳园江浦客运站南【下行】）缩线行驶，起讫站调整为雨山路地铁站南西江佳园【上行】/西江佳园雨山路地铁站东【下行】；510路（江浦客运站南古平岗西【上行】/古平岗西江浦客运站东【下行】）调整走向，起讫站调整为雨山路地铁站南宁工新寓；516路（礼泉路·新北路万达广场南【上行】/万达广场南新北路中【下行】）线路延伸，起讫站调整为雨山路地铁站南万达广场南【上行】/万达广场南雨山路地铁站东【下行】；606路（江浦客运站南扬子江新金融示范区【上行】/扬子江新金融示范区江浦客运站东【下行】）线路延伸，起讫站调整为雨山路地铁站南江北图书馆新馆。【同时G49路起讫站“江北图书新馆”更名为江北图书馆新馆】；686路（江浦客运站西南京云幽谷旅游区【上行】/南京云幽谷旅游区江浦客运站东【下行】）线路延伸，起讫站调整为林景雅园东南京云幽谷旅游区。同时403路、419路、D51路上客站“江浦客运站南”更名为龙华路地铁站（608路、684路下客站同步更名）；403路、419路、605路、612路、D51路、Y29路、Y38路下客站“江浦客运站东”更名为龙华路地铁站北；605路、608路、612路、684路上客站“江浦客运站西”更名为龙华路地铁站西。

2024年09月29日，南京公交403路、419路“龙华路地铁站北”下客站调整至龙华路地铁站。