1994年，烟台市公共交通公司先后开通多条中巴线路：16路中巴（地方港客运站北上坊）、41路中巴（新石路西炮台南路）、42路中巴（幸福小区塔山游乐城）、43路中巴（新石路烟台山）、45路中巴（虹口路南塂）、46路中巴（师范学院宿舍区烟台山）、48路中巴（市公交修理厂虹口路）、49路中巴（新桥小区市建行）；1995年，新辟47路中巴（珠玑小区幸福八村）、52路中巴（青年南路林家疃）、53路中巴（解村莱山区政府）；1996年，新辟12路中巴（火车站奇山小区）、15路中巴（惠安小区长城宾馆）、44路中巴（福斯达纸业名人俱乐部）。

2004年08月26日，烟台城市公交总公司实行42路中巴退市项目，新辟42路大巴，线路实行无人售票，全程1元，起讫站为幸福九村塔山游乐城。

2008年07月02日，烟台城市公交总公司新购置的22辆恒通CKZ6103HN型CNG公交车辆，正式在42路上线运营。

2009年07月，为配合福泰公交场站投入使用，烟台公交2路（幸福八村奇山小区）线路延伸，起讫站调整为福泰公交场站奇山小区；26路（幸福九村汽车西站）线路延伸，起讫站调整为福泰公交场站汽车西站；41路（航天513所海滨小区）线路延伸，起讫站调整为福泰公交场站海滨小区；42路（幸福九村塔山游乐城）线路延伸，起讫站调整为福泰公交场站塔山游乐城；47路（幸福八村塔山游乐城）线路延伸，起讫站调整为福泰公交场站塔山游乐城。

2016年01月27日，烟台公交42路（福泰公交场站（祥和路）塔山游乐城）调整走向，起讫站调整为福泰公交场站（幸福路）塔山游乐城。

2016年06月，烟台公交新购置的162辆舒驰YTK6830GEV1型纯电动公交车辆，正式在3路（含区间）、6路、15路、30路、32路、37路、39路、42路、47路、82路、102路、562路、566路、569路、大润发购物班车、东西南北里专线、昆嵛山区内1号线、昆嵛山区内2号线等线路陆续上线运营。

2017年05月20日，烟台公交西南河站点撤销，涉及21路、22路、42路、43路、44路、46路、80路、80路拥军专线、86路、86路拥军专线。

2022年07月08日，烟台公交新购置的18辆中车TEG6105BEV21型空调纯电动公交车辆，正式在42路上线运营。

2025年02月25日，烟台公交新购置的20辆银隆GTQ6700BEVB30型空调纯电动公交车辆，正式在42路（含政府班车）、82路（含政府班车）上线运营。