2011年12月20日，浦东金高新辟1016路。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，浦东公交（浦东杨高、浦东上南、浦东金高、浦东南汇）除机场七线外所有线路暂停运营。

2022年05月27日，浦东金高130路、778路、791路、984路、1005路、1006路、1010路、1016路、1031路、1033路、1055路、1056路、浦东18路、浦东20路、浦东41路、浦东42路、浦东48路、浦东49路、浦东54路、浦东86路、曹路2路、曹路3路、川沙2路、合庆1路恢复运营。

2024年01月01日，浦东金高四分公司拆分：611路、794路、1006路、1010路、1016路、1017路、1027路、1100路、曹路2路、浦东4路、浦东10路、申崇二线、申崇四线、申崇六线、申崇六线B线、申崇短驳线、高东班车划入二分公司，790路、曹路1路、曹路3路、浦东26路、浦东27路、浦东32路、浦东49路、浦东67路划入三分公司。