2019年08月19日，配合北沿公路施工，道路全线中断，崇明巴士南江专线绕道行驶，堡胜专线全部班次均为堡镇汽车站前进农场区间。新辟堡胜专线短驳线（前进农场长江农场），沿途停靠堡进线、堡胜专线的全部站点，以方便原线乘客出行。（计划至2020年09月30日恢复）

2020年08月17日，受前进农场阿里山路施工影响，崇明巴士堡进线、堡胜专线区间（堡镇汽车站前进农场）临时缩线行驶，起讫站调整为堡镇汽车站前柴路阿里山路；堡胜专线短驳线（长江农场前进农场）临时缩线行驶，起讫站调整为长江农场前柴路阿里山路。（计划至2020年09月30日恢复）

2021年05月12日，配合花博园试运营及正式开幕，崇明巴士南同专线、堡胜专线全程车、崇明乡村10路延伸至花博园P1停车场；南江专线、南东专线改道行驶。

2022年03月20日，根据疫情防控要求，崇明巴士堡胜专线（堡镇汽车站花博园P1停车场）临时缩线行驶，起讫站调整为富民河花博园P1停车场。

2022年03月28日，根据疫情防控要求，崇明巴士所有公交线路暂停运营。

2022年05月20日，崇明巴士恢复多条线路部分区间运营：南东专线恢复南门汽车站东纺厂区间运营；南隆专线恢复南门汽车站长征农场区间运营；南同专线恢复南门汽车站东平商店区间运营；堡胜专线恢复堡镇汽车站长江农场区间运营。

2022年09月15日，崇明巴士堡胜专线全程车（堡镇汽车站花博园P1停车场）调整走向，起讫站调整为堡镇汽车站前卫村。

2023年07月20日，配合林风公路道路全封闭翻修施工，崇明巴士南东专线（南门汽车站前卫村）临时缩线行驶，起讫站调整为南门汽车站东风新村；堡胜专线全程车（堡镇汽车站前卫村）临时缩线行驶，起讫站调整为堡镇汽车站东风新村；南风线临时取消建垦村班次。