1998年08月01日，市公交总公司调整营运线路路别，9路更改为109路，11路更改为140路，12路更改为112路，13路更改为113路，16路更改为116路，17路更改为117路，18路更改为118路，23路更改为123路，24路更改为124路，25路更改为125路，26路更改为126路，27路更改为127路，28路更改为128路，30路泾口更改为130路泾口，30路幽兰更改为130路幽兰，31路更改为131路，34路更改为134路，35路更改为135路，37路更改为137路。2路、5路空调车更名为2Y、5Y。

2022年04月01日，为减少线网重复率，公交集团七公司28路集并公交集团三公司208路，集并后线路划归公交集团三公司；公交集团三公司243路集并883路；公交集团三公司803路起讫站由南塘湖停车场艾溪湖东地铁站调整为南塘湖路中段高新大道地铁站北南塘湖停车场北，163路起讫站由中大公交停车场五星农场调整为金圣路五星农场，860路起讫站由艾溪湖大桥东山湖村调整为北沥一路公交停车场规划四路钱岗安置小区西，新辟860路长班，C3路、C4路、C5路、111路起讫站由绿地未来城调整为塘南水产品市场，578路起讫站由绿地未来城瑶湖大桥调整为瑶湖大桥东湖路学校瑶湖大桥，887路起讫站由公交瑶湖西停车场爱莲街西口调整为瑶湖大桥瑶湖东大道体坛路口瑶湖大桥，C6路暂停运营。因江电场站拆迁，公交集团四公司106路、116路支线、116路A线、116路B线、123路、123路快班、127路、127路西洲线、167路起讫站由江电调整为昌南公交枢纽北门，机场公交2线、176路起讫站由江电调整为自来水公司；因莲塘公交首末站站点停用，公交集团四公司560路、513路、527路、527路长班、134路、C71路、809路、561路、562路、C72路、C73路、C76路、847路、526路、804路、531路、262路起讫站由莲塘公交首末站调整为八一乡桥头。