2009年04月26日，北京公交集团新辟541路（高碑店东劲松）、542路（开发区交通服务中心开发区交通服务中心）、543路（环保科技园城铁龙泽苑站）、544路（环保科技园城铁西二旗站）、545路（吴庄老山西街）、546路（鲁谷公交场站富丰桥西）、547路（望京北路东口和平西桥）。

2016年12月31日，为强化地面公交线网与新开通的地铁16号线的有效接驳，第四客运分公司512路（梅所屯地铁安河桥北站）调整走向并缩短为梅所屯永丰公交场站；544路（环保科技园地铁西二旗站）调整为地铁西二旗站北安河公交场站；633路（杨坨颐和山庄）延长为杨坨百旺新城；642路（五彩城公交场站阳坊北站）拆分为642路（环保科技园阳坊北站）和446路（五彩城公交场站地铁永丰站）；专38路（永丰公交场站翠湖北路西）调整为东埠头村前沙涧村；新辟522路（东埠头村百旺新城）、专16路（海淀驾校地铁北安河站）。

2022年05月12日，按照海淀区疫情防疫工作要求，途经海淀区清河街道及周边划定重点区域的第四客运分公司专29路、专60路、专85路采取暂停运营措施；第一客运分公司专89路、第四客运分公司320路、333路、362路、392路、446路、509路、521路、544路、570路、609路、632路、688路、专128路、夜4路；第八客运分公司902路、963路采取区间运营措施；途经海淀区北太平庄街道重点区域的电车客运分公司专168路采取暂停运营措施；第一客运分公司620路；第三客运分公司69路；第四客运分公司145路、331路、347路、375路、438路采取区间运营措施。

2023年05月10日，按照上级政府部门关于清河火车站枢纽站进驻工作总体安排，结合枢纽站及周边规划道路落实情况，第四客运分公司320路（北京西站地铁西二旗站）、495路（史各庄公交场站地铁上地站）、544路（地铁西二旗站北安河公交场站）、603路（上地六街东口六里桥长途站）、623路（永丰路北站上地五街东口）和专139路（新都东站上地五街东口）全部进驻清河火车站枢纽站，首（末）站调整为“清河火车站”。