2007年12月26日，公交总公司新辟165路（九乡河西路长途东站）、166路（亚东新城区亚东新城区）。

2009年06月30日，公交总公司166路（亚东新城区亚东新城区）拆分为166路（元化路亚东新城区）；177路（元化路亚东新城区）。

2012年08月26日，江南公交166路（元化路亚东新城区）线路延伸，起讫站调整为元化路学林路。

2013年05月10日，江南公交新辟321路（仙居雅苑南大科学园）、323路（紫东创业园金港科创园）；同时159路（经天路地铁站九乡河西路）更名为326路，起讫站调整为经天路地铁站栖霞，166路（元化路学林路）更名为322路，177路（仙林中心站仙林中心站）更名为324路，188路（仙林中心站南汽零件厂）更名325路。

2014年12月24日，江南公交79路（尧佳路东迈皋桥广场）调整走向，起讫站调整为翠林总站迈皋桥广场；322路（元化路学林路）线路延伸，起讫站调整为元化路尧化门。

2021年05月01日，南京公交集团第二客运公司106路、107路、159路、165路、178路、184路、191路、191路区间、197路、198路、199路、200路、321路、322路、326路、327路、328路、329路、335路、344路、B3路、B4路、D1路、D5路、Y34路划归第一客运公司运营管理。

2022年11月12日，南京公交197路、322路起讫站“尧化门”更名，上客站更名为尧化门总站，下客站更名为尧化门总站东。