2013年07月21日，适逢港铁屯门站上盖物业「珑门」基座大型商场VCity于2013年8月开幕，加上屯门站公共运输交汇处有剩余空间，城巴B3M线投入服务，来往深圳湾口岸屯门站。

2020年02月08日，因应新型冠状病毒肺炎疫情，政府推行进一步压缩跨境人流的防疫管制措施，城巴B3线、B3A线、B3M线暂停服务。