2024年09月01日，东部公交调整旗下部分车队编制：二分公司（三联车队）（303路、381路、937路、高峰专线40号）、二分公司（吉华车队）（M138路、M224路、M273路、M324路、M363路、M565路、高峰专线47号）、二分公司（华龙车队）（369路、956路、M414路、M541路）、二分公司（南岭车队）（323路、377路、822路、B881路、B882路、B896路、B898路、B954路、M272路、M428路）、三分公司（长宜车队）（M261路、M265路、M267路、M290路、M370路、M412路、M498路）、三分公司（平安车队）（M270路、M311路、M385路、高峰专线183号）、三分公司（金荣车队）（979路、M154路、M172路、M269路、M283路、M573路）划转至一分公司；一分公司（丰源车队）（M395路、M415路、M452路、高快巴士50号）、一分公司（石岩湖车队）（326路、M233路、高快巴士49号、高快巴士51号）、一分公司（龙华车队）（M188路、M360路）、一分公司（宝安车队）（M234路、M413路）、一分公司（桃源居车队）（M194路、高快巴士32号、高快巴士47号）划转至二分公司；五分公司（汇源车队）（862路、M239路、高峰专线82号）、五分公司（富临车队）（E25路、M139路、M275路、M308路、M316路、M367路、高峰专线17号|D17路|定制巴士3666号）、五分公司（裕民车队）（811路、978路、M149路、M163路、M219路、M280路）划转至三分公司；M229路由三分公司（六和车队）划转至三分公司（吉祥车队）。

2024年12月01日，配合深圳北站交通枢纽公交场站（一层）被改造为网约车接送通道，该站所有线路搬迁至深圳北站交通枢纽公交场站（二层）运作：东部公交M567路、M572路（新田和记总站深圳北站交通枢纽公交场站（一层））调整走向，起讫站调整为新田和记总站深圳北站交通枢纽公交场站（二层）；西部公汽M130路（中海锦城花园公交首末站深圳北站交通枢纽公交场站（一层））调整走向，起讫站调整为中海锦城花园公交首末站深圳北站交通枢纽公交场站（二层）；M352路（华宁路公交首末站深圳北站交通枢纽公交场站（一层））调整走向，起讫站调整为华宁路公交首末站深圳北站交通枢纽公交场站（二层）；高峰专线137号（深圳北动车运用所员工宿舍深圳北站交通枢纽公交场站（一层））调整走向，起讫站调整为深圳北动车运用所员工宿舍深圳北站交通枢纽公交场站（二层）。配合以上调整及同步实施的深圳北站交通枢纽减量工作，巴士集团75路（鹿丹村公交总站深圳北站交通枢纽公交场站（二层））缩线行驶，起讫站调整为鹿丹村公交总站龙悦居公交首末站；M134路（下沙总站深圳北站交通枢纽公交场站（二层））缩线行驶，起讫站调整为下沙总站丰泽湖山庄总站；M207路（东方尊峪公交总站深圳北站西广场公交场站）调整走向，起讫站调整为东方尊峪公交总站深圳北站交通枢纽公交场站（二层）；高峰专线120号（[正向]南山中心区公交总站深圳北站交通枢纽公交场站（二层）/[反向]深圳北站东广场南山中心区公交总站）调整走向，起讫站调整为深圳北站东广场南山中心区公交总站；东部公交E22路（青松翠景路口深圳北站交通枢纽公交场站（二层））线路延伸，起讫站调整为青松翠景路口中梅路公交首末站；M363路（秀峰公交总站深圳北站交通枢纽公交场站（二层））缩线行驶，起讫站调整为秀峰公交总站万科五园公交总站；西部公汽M341路（会展湾南岸广场公交场站深圳北站交通枢纽公交场站（二层））缩线行驶，起讫站调整为会展湾南岸广场公交场站石龙公交首末站；M597路停止运营，为保障硅谷清湖园至坂田片区出行需求，新辟M288路，起讫站为硅谷清湖园公交首末站坂田旭景佳园总站。配合以上调整，巴士集团7路、34路停止运营。