2004年10月09日，因雨花台北大门场站被征收，新城巴士时雨线、宁丹线、雨铜线、雨谷线、宁井线调整走向，起讫站由雨花台调整至雨花台南大门。

2014年03月21日，南京通盛客运有限公司更名为南京江宁公共交通集团有限公司，吸收合并南京新城巴士有限公司，以原通盛客运为主体成立子公司南京东山公交客运有限公司。南京新城巴士有限公司旗下线路101路、102路、103路、104路、105路、106路、119路、137路、148路、164路、180路、190路、191路、192路、D6路、D8路、安丹线、安禄线、安铜线、宁井线、雨谷线、清安线、东铜线、东土线、东周线、东麒线、东旺线、东井线、东上线、金汤线、金秣线、金陆线、金湖线、金麒线、金丹线、区1路、区2路、区3路、区5路、区6路、区8路、区11路、区12路、821路、827路并入南京东山公交客运有限公司运营。

2014年10月25日，东山公交宁井线更名为707路；陆九线更名为769路；东井线更名为867路；滨一线更名为871路；滨二线更名为872路；滨三线更名为873路；滨专线更名为874路。

2019年07月13日，东山公交707路（界牌雨花台南大门）缩线行驶，起讫站调整为界牌油坊桥地铁站，同步实施无人售票，3至2元分段计价。并新辟717路，起讫站为雨花台南大门油坊桥地铁站，无人售票，单一票价2元。

2023年06月01日，为进一步推动长三角一体化，方便南京江宁、安徽马鞍山市民出行，促进两地市民互动交流，实现毗邻公交无缝对接、零距离换乘，宁马慈湖公交枢纽正式启用，马鞍山公交125路（火车站天宝新材料集团）调整走向，起讫站调整为火车站宁马慈湖公交枢纽，东山公交707路、867路、892路起讫站由“界牌”延伸至宁马慈湖公交枢纽。