2019年11月15日，第六客运分公司F13路支线更名为F61路。

2022年05月04日，按照房山区疫情防控工作要求，途经房山区阎村镇封控区周边的第六客运分公司646路、833路、903路、F13路采取区间运营措施；F1路、F2路、F5路、F27路、F43路、F46路、F47路、F48路、F49路、F50路、F57路、F61路、F69路、F70路、F78路、F79路采取暂停运营措施。

2023年08月01日，因京昆路、涞宝路、军红路等山区路段受“7·31洪灾”影响冲毁，第六客运分公司F13路、F14路、F16路、F17路、F19路、F20路、F21路、F22路、F23路、F24路、F25路、F45路、F59路、F60路、F61路、F62路、F63路、F64路、F65路、F66路、F67路、F71路、F72路、F73路、F77路、通勤东湖港、通勤石花洞、通勤朱家坟；第八客运分公司948路暂停运营，恢复时间另行通知。

2023年10月30日，应房山区政府部门要求，为方便西潞地区乘客通学出行，受“7·31洪灾”影响暂停运营的第六客运分公司F61路（红煤厂公交场站太平庄明慧嘉园）恢复运营并调整为良园二路东口太平庄明慧嘉园。

2025年03月26日，为进一步优化公交线路布局、提升公交服务质量、推动智慧交通建设，房山区交通局与第六客运分公司签署了新一轮《房山区域公交客运线路运营管理协议》，由第六客运分公司运营的F1路、F11路、F12路、F13路、F14路、F15路、F17路、F18路、F19路、F20路、F21路、F22路、F23路、F24路、F25路、F26路、F27路、F28路、F29路、F30路、F31路、F32路、F35路、F39路、F40路、F43路、F45路、F46路、F47路、F48路、F49路、F50路、F51路、F52路、F53路、F54路、F55路、F56路、F57路、F58路、F59路、F60路、F61路、F62路、F63路、F64路、F65路、F66路、F67路、F71路、F72路、F73路、F74路、F76路、F77路、F78路、F79路划归京西南客运有限公司运营。